# Paper Skill

> Use when working on academic papers - writing, polishing, reviewing, translating, managing references, creating figures, or preparing submissions for SCI/IEEE/Nature/IJCAI/TRO journals. Also use for thesis defense PPT, paper-to-PPT conversion, LaTeX editing, data availability statements, reviewer response letters, bilingual paper reading, de-AI writing detection, IMRAD/CONSORT/PRISMA/STROBE/SPIRIT/CARE reporting guidelines, journal-first selection strategy, FINER research question scoring, citation integrity & anti-hallucination verification, 7-dimension quality gates, R&R revision traceability matrix, Devil's Advocate adversarial review, CRediT author contributions, ethics & COI declarations, and preprint workflows.

- Skill: `lhh666-6/paper-skill` (Agent Skill, multi-file: 6 files)
- Install (CLI): `npx skillmds@latest add lhh666-6/paper-skill`
- Raw SKILL.md: https://api.skillmd.com/api/skills/lhh666-6/paper-skill/raw
- Safety review: pending
- Works with: Claude Code, Claude.ai, OpenAI Codex
- Category: Research & Search
- Author: lhh666-6 (https://skillmd.com/u/lhh666-6)
- Updated: 2026-09-21
- Page: https://skillmd.com/skills/lhh666-6/paper-skill

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# paper-skill

A prompt library for academic research workflows, covering the full lifecycle from literature reading to journal submission.

Optimized for **SCI / IEEE / Nature / IJCAI / TRO** submissions.

> **Companion modules** — 加载以下模块获得更深度的专项能力：
> - [`citation-integrity.md`](citation-integrity.md) — AI引用幻觉检测、Trust-Chain溯源、DOI核查
> - [`journal-strategy.md`](journal-strategy.md) — 期刊优先决策、FINER评分、期刊风格校准
> - [`quality-gates.md`](quality-gates.md) — 7维度35分质量门控、R&R可追溯矩阵、Devil's Advocate自审

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## Quick Reference by Task

| Task | Section |
|------|---------|
| Identify paper type & structure | [论文类型与叙事结构](#0-论文类型与叙事结构) |
| Read / analyze a paper | [文献阅读与分析](#1-文献阅读与分析) |
| Write a paper from scratch | [论文写作与生成](#2-论文写作与生成) |
| Polish / fix existing draft | [论文润色与修改](#3-论文润色与修改) |
| Review / submission feedback | [论文审稿与投稿](#4-论文审稿与投稿) |
| Reply to reviewer comments | [审稿意见逐点回复](#5-审稿意见逐点回复) |
| Translate paper (CN↔EN) | [论文翻译](#6-论文翻译) |
| Fix / audit references | [参考文献管理](#7-参考文献管理) |
| Debug / generate code | [代码相关](#8-代码相关) |
| Generate figure prompts | [绘图与可视化](#9-绘图与可视化提示词) |
| Make defense PPT | [PPT制作与答辩](#10-ppt-制作与答辩) |
| Read paper bilingually | [中英文对照阅读](#11-中英文对照阅读) |
| Data availability statement | [数据可用性声明](#12-数据可用性声明fair合规) |
| Literature search strategy | [学术文献检索](#13-学术文献检索) |
| Organize files / desktop | [文件与桌面管理](#14-文件与桌面管理) |
| Remove AI writing patterns | [去AI化写作](#15-去ai化写作检测与修复) |
| IMRAD / reporting guidelines | [IMRAD与报告规范](#16-imrad结构与报告规范) |
| Select journal before writing | [期刊优先策略](#17-期刊优先策略) |
| Verify citation authenticity | [引用诚信核查](#18-引用诚信核查) |
| Quality gate self-assessment | [质量门控自评](#19-质量门控自评) |
| CRediT author contributions | [CRediT作者贡献声明](#20-credit作者贡献声明) |
| Ethics, COI & preprint workflow | [伦理声明与预印本](#21-伦理声明利益冲突与预印本) |

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## 0. 论文类型与叙事结构

在起草、润色、制PPT前，先识别论文类型。不同类型对应不同叙事弧（narrative arc）。

| 论文类型 | 叙事弧 | 核心结构 |
|---------|--------|---------|
| **discovery** 发现/机制类 | 问题→证据 | 背景→方法→结果→意义→展望 |
| **methods** 方法/算法类 | 问题→解决方案 | 问题→现有缺陷→创新→验证→应用 |
| **resource** 数据集/平台类 | 工作流→验证 | 动机→构建→规模→基准→用例 |
| **clinical** 临床/人群类 | 设计→推断 | 问题→设计→结果→临床implications |
| **review** 综述/观点类 | 证据地图 | 现状→共识→争议→未来方向 |

### 论文核心创新识别（起草前必做）
```
在正式写作前，请告诉我：
1. 这篇论文解决的核心科学问题是什么？
2. 现有方法/知识存在哪些局限（gap）？
3. 我们的核心创新点是什么（一句话概括）？
4. 最关键的实验证据是什么？
5. 投稿目标期刊是什么？

根据以上信息，确定论文类型（discovery/methods/resource/review），制定写作叙事弧，再进行后续写作。
```

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## 1. 文献阅读与分析

### 精读单篇文献
```
请你仔细阅读这篇文章，给出文章的方法、创新点、实验结果、应用场景，以及这项工作是如何实现持续学习的
```

### 总结研究领域现状
```
总结一下当前[领域名称]的研究现状，有视频的给出视频链接，详细具体给出国内和国外的研究现状，都是用的什么技术实现的，有视频的给出视频链接
```

### 综述撰写（多篇文献）
```
仔细阅读上面所有论文，根据论文写综述，引用标注为[论文完整标题]（不是编号），主题关于[主题方向]
```

### 研究现状罗列（含图）
```
给我[研究方向]的国内外研究现状，把最新的论文罗列出来，包括：文章标题、方法简述、与本工作区别、发表期刊/会议、发表时间、期刊级别，并呈现关键图
```

### 深度阅读（提取论证链）
```
详细阅读这篇论文，提取：
1. 主要科学主张是什么？
2. 可见的证据基础是什么（图表、数据）？
3. 声称的重要性（为什么读者应该关心）？
4. 明显的局限性是什么？
5. 与本领域现有工作的关系？
```

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## 2. 论文写作与生成

### 从材料生成完整论文
```
这两个材料都是我的论文，其中[文件名]是最新且最正确的材料，另外一个包含图片，请结合两个材料生成我的最新论文，你是[期刊]编委，数学公式请生成可编辑的LaTeX版本，生成最终的论文word格式
```

### 修改核心创新点表达（非并列结构）
```
我论文最核心的创新是[核心描述]，其它的作为辅助。你现在写法像并列结构，需要修改这种结构，让核心创新点突出，按照我说的来写，生成修改后的完整中文论文word文档
```

### 重写方法部分（SCI一区，中文）
```
重写方法部分，方法部分逻辑混乱，我要投稿SCI一区，请帮我重写方法部分，中文生成
```

### 重写实验部分（SCI一区，中文）
```
重写实验部分，现在实验部分全部都有问题，我要投的是SCI一区的期刊，中文生成，不要编造我的文章里没有的数据
```

### 根据PDF材料填写调查报告
```
根据我的[PDF文件名]，把[相关内容/大模型相关内容]填写到[调查报告/表格]里面
```

### 从上传论文中选取参考文献
```
根据我的课题技术方案，从我上传的论文里面选取几篇最能参考的论文，列出标题和论文简要内容
```

### 生成引言（含参考文献）
```
生成完整的引言，以及引言所包含的所有参考文献（标题，发表时间，所属期刊或会议）
```

### 生成相关工作（含参考文献）
```
生成完整的相关工作，相关工作部分需要引用5篇[目标期刊]的[年份范围]的研究，其它研究需要最新的一区二区和顶会，给出所有引用参考文献（标题、发表时间、期刊/会议）
```

### 引言/相关工作写法规范
```
引言和相关工作要改成：谁提出了什么方法，做了什么工作，有什么局限性，我们针对这些局限性做了什么。一定要客观，禁止批评别人的方法，禁止踩一贬一
```

### SCI一区论文写作指导（从数据/毕设起步）
```
这个是我的[毕业论文/实验数据]，请你仔细阅读所有材料，我现在要在现有资料基础上写一篇SCI一区论文，给我一个详细完整的论文写作指导和全文框架，以及生成一篇论文，所有内容生成完整word在桌面上
```

### 检查证据与主张的对应关系
```
你是[期刊]审稿人，检查这篇论文中：
1. 每个核心主张是否有对应的实验证据支撑？
2. 是否存在主张大于证据的情况（over-claim）？
3. 图表与正文描述是否一致？
4. 哪些局限性被忽略或低估了？
请逐点列出，并给出具体修改建议。
```

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## 3. 论文润色与修改

### 全文语法/标点错误检查
```
检查一下这个论文里有没有明显的错误，语法，标点符号，表达等，这个将要发表，帮我检查有没有错误
```

### 段落学术化改写
```
从学术论文的角度修改这段话
```

### 顶刊标准全文纠错
```
你是顶刊期刊编委和审稿人和学术专家，技术大牛，帮我纠正我的论文错误，全文纠正，包括方法，实验，引言，摘要，结论
```

### IJCAI审稿人视角修改（含overleaf对照）
```
你是IJCAI顶会审稿人，并且还是主编，告诉我这篇文章在逻辑、语句、原理方法、实验结果上是否存在致命的会导致拒稿的问题？请一一罗列并告诉我如何修改，给出具体替换语句，生成中英对照版和overleaf格式版本，详细标注修改的地方
```

### 论文精简（保留原意，含overleaf）
```
精简一点（保留原意和原overleaf格式），去掉冗余部分重新生成中英对照版本，不要丢失参考文献。需要详细告诉我原来是什么，如何修改，在哪里修改
```

### 按TRO风格润色（方法/实验/相关工作）
```
这个是论文[部分名称]，帮我按照SCI一区、TRO的学术语言风格进行润色，要求逻辑缜密，如果原理不对的话请修改出来，生成修改后的完整[部分名称]
```

### IEEE TRO冗余精简（含latex修订）
```
你是IEEE TRO审稿人和编委，文章现在太啰嗦冗余了，保留核心简要的，删去冗余，告诉我具体修改哪里，用什么句子替换，不要省略，生成完整修改说明中文word
```

### 公式符号规范检查
```
根据我论文的方法部分，帮我看一下图里面的公式字母表述对不对，图里面有公式字母没有对应上论文方法部分的描述，详细告诉我如何修改。要求：变量斜体，函数/常量正体，字母下标不要用英文单词，变量简洁，生成完整修改意见word，公式需要latex格式
```

### 实验数据更新（含标红对比）
```
[描述新增实验数据变化]，帮我更新论文里所有表格数据，包括论文部分所有涉及到这个的描述，生成完整版论文，你修改的地方标红，防止乱码，我是wps打开的，生成完整中文版word
```

### 公式全部转为 LaTeX 格式
```
帮我把论文里面的公式全部改成latex格式的，现在全是一些字符，不是公式，你参考我上传的pdf的公式样式修改，其他地方不要修改，生成修改后的完整论文word文件
```

### 论文冗余精简（含修改报告，TRO标准）
```
这个是我的论文初稿，准备投稿TRO的，但是写的太冗余了，把里面的废话删除，你是编委，帮我修改润色，需要达到TRO标准，逻辑缜密，生成修改报告，详细具体到哪个地方需要怎么修改
```

### 论文修改（纯中文输出）
```
这个是我的论文初稿，写的太冗余了，帮我修改，生成修改后的中文版，讲清楚具体是如何修改的（修改哪里，怎么修改），生成修改的word，全中文版，不要出现英文
```

### LaTeX 排版修复（浮动体/图表位置问题）
```
我的LaTeX论文存在排版问题：[描述问题：页面稀疏/图表不填满页面/跨页/Float too large/标题孤立/多面板图表排列混乱]

你是Nature主编，帮我诊断并修复LaTeX排版，要求：
1. 先描述具体问题是什么
2. 给出修改哪一行/哪个位置
3. 给出可以直接替换的latex代码
4. 解释为什么这样修改
修改前和修改后的对比都要给出来，生成完整word修订报告
```

### 段落失败模式诊断（写作质量审计）
```
你是Nature审稿人，对这段/这部分文字进行失败模式诊断：
1. 主张→证据→意义的逻辑链是否完整？
2. 是否存在冗余重复或逻辑跳跃？
3. 句子结构是否符合Nature学术风格？
4. 如果无法在不添加内容的情况下修复结构问题，请标记而非覆盖
给出修改建议和替换语句
```

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## 4. 论文审稿与投稿

### 论文总结与优缺点
```
总结全文，你是审稿人，给出论文总结、优缺点，以及明显的问题
```

### 指定期刊投稿意见
```
我要投稿的期刊是[期刊名]，给我关于论文的修改意见以及绘图意见，详细准确，分析我的论文结构有没有需要改进的地方
```

### Nature Communication 写作
```
这是我的研究内容，我计划投稿nature communication，给出投稿建议，给出论文标题，你是nature审稿人，根据我的研究内容帮我直接写一篇完整的nature communication
```

### IEEE TRO 找拒稿漏洞（含修改清单）
```
你是IEEE TRO审稿人，帮我找到会导致拒稿的致命漏洞，包括逻辑，理论，实验，以及全文，在不补实验的基础上，给我一个修改清单，包括修改哪里，如何修改，用什么描述语言替换，生成完整word
```

### IEEE TRO 审稿意见（中文，含latex）
```
你是IEEE TRO审稿人和编委，给出审稿意见和最终结果，检查致命问题，在不补实验基础上给详细修改说明。给我中文版修改意见，修订直接在latex上修改，给我可以复制进去替换的latex代码，精确告诉我修改哪一行，修改前后对比都要给出来，解释为什么这样修改，生成完整word。
要求：LaTeX代码块精确可搜索；排版清晰，修改前/后严格对齐
```

### IEEE TII 审稿人视角（全文审阅）
```
你是IEEE TII顶刊SCI一区审稿人，并且还是主编，告诉我这篇文章是否存在致命的会导致拒稿的问题，请一一在原文中标注出来，详细告诉我如何修改，给出具体修改替换语句，生成标注后的pdf在桌面上
```

### IJCAI 发表前全文校对（含latex）
```
帮我对这篇即将发表的文章进行全文检查，检查是否有图片字体错误、单词拼写错误、参考文献错误、表格错误或其他明显错误，帮我进行校对勘误，生成详细具体修订word，修订直接在latex上修改，给我可以复制进去替换的latex代码，生成word在桌面上
修订报告格式参考：[参考word路径]
```

### 小修后对照检查（TII）
```
你是IEEE TII审稿人，检查这篇论文是否按照小修意见进行了修改，检查图片字体、单词拼写、参考文献、表格是否有明显错误，帮我校对勘误，生成详细具体修订word
```

### 预审稿报告（Nature 审稿人风格，3份+综合）
```
你是Nature审稿人，对这篇论文给出预审稿评估。请返回：

Reviewer 1、Reviewer 2、Reviewer 3（三位审稿人仅在侧重点上有所不同，不要编造审稿人身份）：
- 总体评估
- 哪类读者会对结果感兴趣，以及为什么
- 主要优点
- 主要问题
- 必须解决才能建立论文论证的技术缺陷
- 针对Nature标准的评估（originality、scientific importance、technical soundness、readability）
- 录用建议

Cross-review synthesis：
- 三位审稿人的共识优点
- 共识技术风险
- 各审稿人侧重差异
- 最重要的待解决问题

注意：只基于提供的论文内容评估，不编造图表细节、引用或论文中不存在的内容
```

### Science Robotics 投稿（含实验补充建议）
```
这个是我的论文及附件材料，我要投稿Science Robotics，请给出修改建议，以及实验补充建议，详细到如何做补充实验，以及视频拍摄剪辑，你是Science Robotics的期刊编委，我要保证这篇文章在Science Robotics的录用率在90%，直接帮我修改，包括实验表格，需要绘制什么图，生成最终的修改论文word，中文版本
```

### 竞赛评委意见（国创大赛）
```
你是国创大赛的国赛评委，请给出评审意见，最终能获得几等奖，然后给出详细完整的修改意见，针对每页的修改建议。我需要拿国家级一等奖，生成详细的word
```

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## 5. 审稿意见逐点回复

### 确定修改策略（triage优先）
```
这是期刊的审稿意见，请先帮我分类每条意见：
- 必须做实验响应的（Major concern）
- 可以通过解释/澄清解决的（Minor / Clarification）
- 审稿人的主观意见，可以礼貌不同意的

然后给出回复策略总结：哪里需要补实验，哪里只需要解释，哪里可以措辞分歧。
不要编造实验结果或凭空添加数据。
```

### 起草逐点回复信（point-by-point）
```
你是顶刊论文作者，请帮我起草逐点回复信。

要求：
1. 对每条审稿意见（R1.1, R2.1等）逐一回复
2. 格式：审稿人原文 → 作者回复 → 论文对应修改位置（或标注AUTHOR_INPUT_NEEDED）
3. 语气：尊重但坚定，措辞学术化
4. 不编造实验结果；如需作者补充信息，明确标注[作者需提供：XXX]
5. 生成完整word，包含所有回复和修改位置映射
```

### 大修回复（含修改位置映射）
```
这是大修审稿意见，请帮我：
1. 提取并编号所有编辑意见（E.1等）和审稿人意见（R1.1, R2.1等）
2. 对每条意见起草回复，说明：我们如何响应 + 在论文哪个位置做了什么修改
3. 凡是需要我来补充决定或数据的地方，标注[作者需提供：XXX]
4. 生成最终的回复信word，附修改跟踪表

注意：我是[中文/英文]作者，请对应输出语言
```

### 难以响应的意见处理
```
审稿人提出的这条意见很难响应：[意见内容]

请帮我分析：
1. 这是技术缺陷还是主观偏好？
2. 是否必须做实验？还是可以通过澄清+补充讨论解决？
3. 如果在不补实验的情况下，最佳的回复措辞是什么？
4. 有没有论文中已有的证据可以用来支持我们的立场？

给出具体的回复语句建议
```

### 审稿回复QA检查
```
这是我起草的审稿回复信，请检查：
1. 每条审稿意见是否都有回复（有没有遗漏）？
2. 每个声称的修改是否都映射到了具体的论文位置？
3. 语气是否尊重且学术化？
4. 是否有编造数据或声称了不存在的修改？
5. 是否有需要作者决定但还未填入的placeholder？
生成修订后的完整回复信word
```

### TII审稿人对返修回复进行评审（生成4个文件）
```
你是TII审稿人及编委，我上传了我的论文和审稿返修意见回复的文档，作为编委和审稿人，请你对我的回复进行评审以及意见修改，详细修改，生成整个评审意见和修改报告，以及直接在我的原文（论文和审稿回复word）中批注出来，生成批注后的两个文件以及评审意见和修改报告4个文件，全是word格式
```

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## 6. 论文翻译

### 全文中译英（学术化，Nature标准）
```
把论文全文翻译为英文，不要丢失参考文献标号和公式，你是nature主编，需要百分百确保翻译后的英文意思和我原来的中文一模一样，不要改变我的意思，需要非常准确及学术化，生成完整word在桌面
```

### 部分章节中译英
```
把论文的[摘要/引言/相关工作/公式部分]翻译为英文，不要丢失参考文献标号和公式，并为公式编号，生成完整word在桌面，[其它部分]保持原来的中文不变
```

### 翻译准确性校对（标蓝标红）
```
对比一下翻译的是否准确，不准确的地方请帮我修改，修改前标蓝，修改后标红，并中文说明修改原因，生成修改后的完整word在桌面上
```

### 实验部分翻译校对
```
对比一下实验部分的翻译是否准确，不准确的地方请帮我修改，修改前标蓝，修改后标红，中文说明修改原因，生成修改后的完整word和详细修改说明报告（只标红要修改的句子，不要大段大段标红），只对比实验部分
```

### 审稿意见英译中
```
把这个审稿意见翻译为中文版本的word在[目标路径]下，帮我排版好，以及给我如何修改论文的建议
```

---

## 7. 参考文献管理

### 参考文献顺序编排
```
帮我把文中的参考文献编号按照顺序编排，检查文章中提到的这些参考文献是否与文章描述内容相符，不相符或有较大差异的请在文中标注出来，其它的不要改动，生成修改后的完整word在桌面上
```

### 参考文献与引用内容匹配检查
```
帮我详细检查全文的参考文献以及对应引用内容对不对，引用的文献及其对应的内容是否匹配，生成详细修改word，在文章中直接修改，修改的地方标红，原来的地方标蓝，形成对比
```

### 核实引用文献真实性
```
确认一下这里面的参考文献是否正确，是否真的有这些参考文献，每个参考文献引用的内容是否正确，仔细查看阅读每个参考文献，如果错误请纠正指出
```

### 检查重复/错误参考文献
```
帮我检查有没有重复的和错误的参考文献，如果有请帮我修改，你是SCI一区编委，检查文章中是否有逻辑错误、语病或需要修改润色的地方，有的话标红并指正，生成修改后的完整word
```

### 添加引用句（相关工作）
```
在相关工作对应的地方添加一句话，把[传统方法/经典文献]与本方法的区别与联系加进去，以提升论文学术深度。告诉我在具体哪个位置添加，添加什么内容
```

---

## 8. 代码相关

### 报错修复（含调试验证）
```
上面是我的代码，报错为：[错误信息]。解决报错，修改后你自己调试10遍，确保可运行且没有报错，然后生成完整代码给我
```

### 定向修改代码（告诉我改哪里）
```
这个函数，你告诉我修改哪里，怎么修改
```

### 视频逐帧导出
```
把这个视频帮我导出为一帧一帧的图片，按每s一帧进行导出，导出到[目标路径]这个文件夹下面
```

### Isaac Sim 关节控制（cmd命令行）
```
仔细阅读这个链接，我要如何在isaac sim中控制机器人usd的各个关节（cmd命令行控制）：https://docs.isaacsim.omniverse.nvidia.com/4.5.0
```

### 宇树强化学习地形相关代码排查
```
这个是宇树的开源项目 https://github.com/unitreerobotics/unitree_rl_gym ，我修改了地形后在训练的时候还是平地，你帮我看看这个代码里涉及地形的还有哪几个代码？
```

### LeRobot 数据采集方法（详细）
```
仔细阅读这个项目，详细具体告诉我如何采集数据：https://github.com/huggingface/lerobot
```

### 强化学习抓取优化（含课程/奖励/归一化）
```
我要实现强化学习稳定抓取，帮我优化，提出改进意见，包括观测标准化（RunningNorm）、奖励简化与可视化、课程前进/回退（hysteresis）等方面
```

### 硬件原理图问题解决
```
pdf是我的硬件原理图，根据这个原理图帮我解决项目日志word里的问题，详细面对每个问题提出最靠谱的解决方案
```

---

## 9. 绘图与可视化提示词

### 图表合同（绘图前必做）
```
在绘制图表前，先回答以下问题：
1. 这个图表要证明的核心结论是什么（一句话）？
2. 数据如何支持这个结论（证据逻辑）？
3. 最适合的图表类型是什么（线图/柱图/热图/散点图）？
4. Hero panel是哪一个（最能展示核心结论的子图）？
5. 投稿期刊是什么？需要什么分辨率和格式（PNG@300dpi/PDF/TIFF）？
6. 调色板约束（最多3-4种颜色，黑白可读）？

确认以上信息后再开始绘图。
```

### 方法流程图提示词（nano banana）
```
这些是我的代码，我要投稿SCI一区，根据我的方法生成详细的AI提示词，用于nano banana绘图（方法流程图），只要一个完整的详细的提示词，不要生成无关内容，学术美观，nature级别。按照AI顶会标准，提示词需要非常详细，包括配色、用什么元素、多加图标和元素图
```

### 实验结果图提示词（nano banana）
```
这个是我的论文，我上传的是我的实验结果图，我的[实验名]是验证[实验目的]，生成实验结果图的排版重制AI提示词，用于nano banana绘图（实验结果图），只要一个完整的详细的提示词，学术美观，nature级别
```

### 对比图提示词（基于表格）
```
我打算把[表1、表2、表3]画成对比图，有什么好看直观学术化的图能表示的？生成AI提示词，用于提示[目标AI工具]进行结果分析图绘制，不要生成无关内容，我只要提示词
```

### 实验数据可视化（从表格到图）
```
我实验部分，哪些表格里的结果可以画成数据结果分析对比图？都帮我画成对比图，生成修改后的论文全文word在桌面上，图片放在桌面新建的文件夹里
```

### 图注与题名生成
```
对这张图生成标题和图注以及针对论文正文的引用
```

### 表格 Nature 风格优化
```
这个表格帮我进行优化，按照nature的优化美化风格，其它的不要改动，生成修改后的完整word在桌面上
```

### 概念元素图提示词（智能体/产品）
```
结合我的产品手册，智能体，就是一个[设备描述]的元素图，给我用于nano banana绘图的AI提示词就行，生成.txt文件在桌面上，元素图是中文的
```

### 图表质量审计（出版前）
```
你是Nature图表编辑，审查这张图的出版质量：
1. 分辨率是否足够（≥300 DPI for raster）？
2. 字体大小是否在投影/印刷时可读（≥8pt）？
3. 颜色是否对色盲友好？黑白打印时是否可区分？
4. 误差棒/显著性标记/n值是否完整？
5. 图注是否完整（包含所有panel说明、统计方法、样本量）？
6. 子图标签（A、B、C）是否清晰一致？
给出具体修改建议。
```

### BioRender风格结构图重绘（SVG）
```
帮我把这个结构图补充详细了重新绘制一张，按照第二张图片，在第一张图的基础上修改，要求biorender风格，SVG格式
```

---

## 10. PPT 制作与答辩

### 从论文生成转博答辩PPT（论文类型驱动）
```
这些是我的研究材料，根据以上材料完善和修改我的转博答辩PPT。

首先识别我的研究类型（discovery/methods/resource），确定叙事弧，然后：
- 要求具备博士深入提出科学问题、聚焦科学问题并解决科学问题的学术能力
- 每个slide必须推进论证，不是简单罗列
- 所有slide内容和演讲稿用中文
- 生成修改后的完整PPT，不要生成无关内容
```

### 修改PPT某一页
```
这个PPT的[某一页]的内容要修改一下，[修改内容描述]，生成修改后完整的一页PPT给我
```

### 从PPT生成演讲稿+评委问题
```
这是我的答辩PPT，请根据我的PPT生成完整的演讲稿，及5位评委可能会问的问题及其详细解答，生成完整word
```

### 论文PPT化（含研究现状对比）
```
[描述修改内容和方向]，重新生成完整PPT。加上当前研究现状：有没有人用了同样的方法，把文章标题、方法简要描述、与本工作的区别、发表期刊/会议、发表时间、期刊级别一起列进去
```

### PPT Slide质量检查
```
检查这个PPT的质量：
1. 是否有broken figure references或missing images？
2. 是否有text overflow（slide上文字过多）？
3. 每个slide是否只传递一个核心信息？
4. 论证flow是否清晰（背景→问题→方法→结果→意义）？
5. 术语是否在整个deck中一致？
6. 图表质量是否足以投影展示？
给出修改建议，生成修改后的完整PPT
```

### 应用案例PPT（机器人化学实验应用）
```
应用案例加一个精准机器人化学实验师，用我这个设备来做化学实验的，生成PPT
```

---

## 11. 中英文对照阅读

### 全文中英文并排阅读（含图表定位）
```
请帮我阅读这篇论文，生成完整的中英文并排Markdown阅读文档：

要求：
1. 每个章节：英文原文 + 中文翻译并排
2. 所有图表和表格在对应文字位置就近呈现（不要只放末尾）
3. 建立术语表（科学术语保留英文，括注中文）
4. 不要降级为摘要或概述——我需要完整的内容
5. 如果图表提取有问题，在注释中说明，但不要省略内容
6. 保留所有参考文献编号

来源：[PDF路径 / DOI / arXiv链接 / 粘贴文本]
```

### 论文精读（提取核心论证）
```
详细精读这篇论文：
1. 科学问题是什么？
2. 作者的核心主张是什么（一句话）？
3. 关键证据是什么（关键图表、数据）？
4. 方法的核心创新点是什么？
5. 实验验证了什么，有什么局限？
6. 这个工作对[我的研究方向]有什么参考价值？

用中文输出，重要术语保留英文
```

### 快速论文摘要（组会/汇报用）
```
请快速总结这篇论文，用于组会汇报：
- 一句话：这篇文章做了什么
- 背景与动机（2-3点）
- 方法核心创新（2-3点）
- 最重要的实验结果（1-2个关键数字或图）
- 局限性与未来方向
- 与我研究的相关性

控制在500字以内，中文输出
```

### 术语对照表生成
```
阅读这篇论文，生成论文中所有专业术语的中英对照表：
- 模型/方法名称
- 数据集名称
- 指标名称
- 领域专有名词
- 缩写展开

格式：英文术语 | 中文译法 | 首次出现位置
```

---

## 12. 数据可用性声明（FAIR合规）

### 起草数据可用性声明
```
请帮我起草这篇论文的数据可用性声明（Data Availability Statement）。

我的数据情况：
- 新生成的数据：[描述数据类型和存放位置/计划存放位置]
- 重复使用的公开数据：[数据库名称和accession number]
- 代码/脚本：[GitHub链接或计划]
- 是否有受限数据（临床/隐私）：[是/否，原因]

要求：
1. 符合[Nature/IEEE/目标期刊]的数据共享要求
2. 每个数据集明确映射到具体repository和identifier
3. 不编造DOI或accession number，未确定的用[AUTHOR_INPUT_NEEDED]标注
4. 遵循FAIR原则（可发现、可访问、可互操作、可复用）
5. 生成英文版（如需中文说明也一并提供）
```

### FAIR元数据审计
```
对这篇论文的数据共享方案进行FAIR审计：

Findable（可发现）：
- 是否使用了持久标识符（DOI/accession number）？
- repository中是否有清晰的元数据和描述？

Accessible（可访问）：
- 是否提供了公开URL或accession number？
- 如果是受限访问，访问流程是否清晰？
- 许可证是否明确说明？

Interoperable（可互操作）：
- 是否使用了标准化格式（FASTQ/CSV/etc）？
- 是否包含文件格式说明和README？

Reusable（可复用）：
- 许可证是否允许再用？
- 数据来源和版本控制是否记录？

列出每个数据集的FAIR合规状态，以及需要改进的地方
```

### repository选择建议
```
我的论文数据类型是[基因组测序/单细胞/图像/化学/材料/通用/代码]，
目标期刊是[期刊名]，
请推荐合适的数据repository，并说明：
1. 推荐的repository名称和网址
2. 如何获取accession number或DOI
3. 需要准备哪些metadata
4. 数据许可证建议
```

---

## 13. 学术文献检索

### 多源文献搜索策略
```
我需要检索关于[研究主题]的文献，请帮我：
1. 构建搜索关键词（Boolean operators + 同义词扩展）
2. 确定应该在哪些数据库检索（PubMed/arXiv/Scopus/Google Scholar，根据学科）
3. 给出具体的搜索语句
4. 说明如何过滤（发表年份：[年份范围]，期刊级别：一区二区/顶会）
5. 如果结果太多，如何进一步精炼

学科领域：[生物医学/计算机/工程/其他]
```

### MeSH检索策略（生物医学）
```
帮我构建关于[研究主题]的PubMed MeSH搜索策略：
1. 识别核心MeSH主题词和qualifiers
2. 构建完整Boolean查询语句（含Explode和限定符）
3. 给出预期结果量评估
4. 提供用于后续复用的查询字符串

目标：找到[年份范围]内发表在高水平期刊上的相关文献
```

### 引用文献真实性核查
```
请帮我核查以下引用文献是否真实存在且与引用内容匹配：

[粘贴引用列表或文章段落]

检查内容：
1. 作者、标题、年份、期刊是否一致
2. 引用的内容描述是否与原文相符
3. 标注不确定或需要手工确认的条目

对于无法确认的条目，请明确标注[需要手工核实]
```

### 相关文献发现（给定一篇种子论文）
```
给定这篇论文：[标题/DOI/arXiv链接]

请帮我找到：
1. 该论文引用的最重要的5-10篇基础文献
2. 引用该论文的重要后续工作
3. 同期发表的相关工作（parallel work）
4. 与该论文方法最相关的近3年新工作

按照相关性排序，给出标题、作者、期刊、年份、DOI
```

---

## 14. 文件与桌面管理

### 桌面整理归类
```
帮我整理桌面路径[路径]，进行归类分类，并生成修改的路径导览，导览生成word格式在桌面上，需要详细具体到每个文件名+后缀
```

### Excel表格整理美化
```
这个子表也帮我整理一下，覆盖掉原来的子表，颜色太单调了，区分一下，突出重点
```

### 研发成本与售价表
```
根据这个战略合作协议生成研发成本和售卖价格，研发成本可以高，售卖价格按硬件成本加软件费，[产品描述]，生成研发成本和售价表格作为一个word在桌面上
```

### 合同/协议分析
```
我是CTO，帮我分析一下这个协议里对我不合理的地方，帮我标红，并告诉我如何修改，生成完整word给我
```

### 试卷详细解答生成
```
给出这套试卷的详细解答，公式用latex格式，不要生成代码或者符号，生成完整的详细的解答word在桌面上，需要非常详细，能够教人学会，给出非常非常详细的步骤，相当于你是老师
```

### 期末作业生成（含图表和参考文献）
```
期末作业的主题是[主题]，字数要求在1500字以上，帮我生成这个，包含图片和表格，包括真实有效的参考文献，要有图片
```

---

## 15. 去AI化写作检测与修复

AI生成的学术文本有18类可识别模式，投稿前必须清除，否则容易被编辑或审稿人识别为AI写作。

### AI写作18类高频模式

| # | 模式名称 | 典型词/句 | 修复方向 |
|---|---------|---------|---------|
| 1 | **显著性通胀** | groundbreaking, revolutionary, unprecedented, transformative | 改用客观数据描述，删去形容词 |
| 2 | **AI高频词** | delve, intricate, nuanced, robust, pivotal, leverage, commendable, multifaceted | 换成具体名词或动词 |
| 3 | **填充过渡词** | Furthermore, Moreover, Additionally, It is worth noting that, Notably | 直接进入下一个论点 |
| 4 | **模糊量化** | several, numerous, a variety of, many, various | 改用具体数字或范围 |
| 5 | **过度规避** | may potentially, could possibly, might perhaps, it is possible that | 保留一个模态词，删去叠加 |
| 6 | **对称式列举** | Firstly…Secondly…Thirdly…Finally | 改为段落逻辑而非枚举 |
| 7 | **空洞结语** | In conclusion, In summary, To summarize, Overall, Taken together | 直接给出核心结论，删去引导句 |
| 8 | **元评论** | This section will discuss…, In this paper, we present… | 直接陈述内容，不要预告 |
| 9 | **反复前指** | As mentioned earlier, As discussed above, As previously stated | 重组段落结构以消除重复引用 |
| 10 | **领域套话开头** | In the realm of, In the field of, In the context of, With the advent of | 以具体问题或数据开头 |
| 11 | **全知免责声明** | To the best of our knowledge, As far as we are aware | 只在首次提及新颖性时使用一次 |
| 12 | **情感性强调** | very important, quite significant, rather crucial, extremely valuable | 删去副词，改用evidence支撑 |
| 13 | **修辞问句** | But what does this mean for…? How can we address this challenge? | 删去，直接给答案 |
| 14 | **被动语态滥用** | It was observed that, It has been shown that, It can be seen that | 改主动句，明确施动者 |
| 15 | **平行结构堆砌** | X not only…but also…and furthermore… | 拆分为两个独立句子 |
| 16 | **假精确** | approximately 98.7% of cases, nearly all researchers | 给出真实数据来源或删去 |
| 17 | **显而易见陈述** | It is clear that, Obviously, Evidently, Needless to say | 直接给事实，不要预判读者判断 |
| 18 | **句式单一化** | 每句都是"Subject + verb + object"的简单结构 | 混合使用从句、分词短语、倒装 |

---

### 全文去AI化扫描（一键检测18类模式）
```
你是学术写作编辑，对这篇论文/段落进行去AI化检测：

请扫描以下18类AI写作模式并逐一标注：
1. 显著性通胀词（groundbreaking/revolutionary/unprecedented）
2. AI高频词（delve/intricate/nuanced/robust/pivotal/leverage/commendable/multifaceted）
3. 填充过渡词（Furthermore/Moreover/Notably/It is worth noting）
4. 模糊量化（several/numerous/a variety of）
5. 过度规避（may potentially/could possibly/might perhaps）
6. 对称式列举（Firstly...Secondly...Thirdly）
7. 空洞结语（In conclusion/In summary/To summarize）
8. 元评论（This section will discuss/In this paper we present）
9. 反复前指（As mentioned earlier/As discussed above）
10. 领域套话开头（In the realm of/In the field of/With the advent of）
11. 全知免责声明（To the best of our knowledge）滥用
12. 情感性强调（very important/quite significant/rather crucial）
13. 修辞问句
14. 被动语态滥用（It was observed that/It has been shown that）
15. 平行结构堆砌
16. 假精确（无来源的近似数字）
17. 显而易见陈述（It is clear that/Obviously/Evidently）
18. 句式单一化

输出格式：
- 每条模式：原句 → 修改建议 → 修改后版本
- 标注严重程度（高/中/低）
- 最后给出整体AI痕迹风险评分（0-10）
生成完整检测报告word
```

### 指定模式精准清除
```
对这段文字，精准清除以下AI写作模式：[从上表选择1-3个模式编号]

要求：
1. 找出所有该模式的实例
2. 给出每处的修改建议和替换句
3. 不改变原文的科学意思和数据
4. 修改前标蓝，修改后标红
5. 生成修改后的完整段落
```

### 语言自然度提升（使人类化）
```
这段文字AI痕迹明显，请在不改变科学内容的前提下使其更自然：

要求：
1. 删除所有填充过渡词和套话开头
2. 将平行列举改为有层次的论证结构
3. 被动句改主动，明确施动者（作者/数据/模型）
4. 删除情感性副词，改用数据/证据支撑
5. 混合句式长度（20-30词的长句 + 10词内的短句）
6. 保留所有专业术语、数据、引用标号不变

生成修改后的段落，并标注每处改动原因
```

### 摘要去AI化（高风险区域）
```
论文摘要是AI检测重点区域，对这个摘要进行去AI化重写：

禁止使用：groundbreaking, revolutionary, unprecedented, delve, intricate, robust, pivotal, leverage, Furthermore, Moreover, It is worth noting, In conclusion, In this paper we propose, To the best of our knowledge（只允许出现一次）

要求：
1. 第一句直接给出研究问题或核心发现，不要从背景开始
2. 方法：具体描述做了什么，不用"we propose a novel framework"
3. 结果：给出关键数字和对比基线
4. 意义：一句话，具体到哪类读者/应用会受益
5. 控制在250词以内
生成修改后的摘要
```

### 投稿前AI痕迹快速自查清单
```
投稿前30秒自查，对这篇论文快速检查：
1. 摘要第一句是否以"In recent years"或"With the rapid development of"开头？（如是，改掉）
2. 全文是否有"delve into"？（删去）
3. 引言是否有3个以上"Furthermore/Moreover/Additionally"段首？（精简）
4. 结论是否以"In conclusion/In summary"开头？（删去，直接陈述）
5. 全文是否有"It is worth noting that"？（删去）
6. 是否有连续3句以上"It was found that/It was observed that"？（改主动）
7. 是否有"groundbreaking/revolutionary/unprecedented"？（删去）

逐条检查并给出修改，生成快速修改报告
```

---

## 16. IMRAD结构与报告规范

IMRAD是实验性研究论文的标准结构（Introduction, Methods, Results, And Discussion）。临床/观察性研究额外需要遵循报告规范（CONSORT/PRISMA/STROBE等）。

### 主要报告规范速查

| 规范 | 适用类型 | 核心要求 | 官方清单 |
|------|---------|---------|---------|
| **CONSORT 2025** | 随机对照试验（RCT） | 25条目，含分配隐藏、盲法、CONSORT流程图 | consort-statement.org |
| **PRISMA 2020** | 系统综述/Meta分析 | 27条目，含检索策略、PRISMA流程图、偏倚评估 | prisma-statement.org |
| **STROBE** | 观察性研究（队列/病例对照/横断面） | 22条目，含暴露/结局定义、失访处理 | strobe-statement.org |
| **ARRIVE 2.0** | 动物实验 | 21条目，含样本量计算、随机化、盲法 | arriveguidelines.org |
| **SPIRIT** | 临床试验方案 | 33条目，注册前使用 | spirit-statement.org |
| **CARE** | 病例报告 | 13条目，含时间轴、患者视角 | care-statement.org |
| **IMRAD** | 实验性研究（通用） | Introduction/Methods/Results/Discussion四段结构 | — |

---

### IMRAD结构写作指导
```
根据IMRAD结构，对这篇[实验性/方法类]论文进行结构诊断：

Introduction（引言）应包含：
- 研究背景与知识gap（漏斗式从宽到窄）
- 现有方法的局限性（逐条列出）
- 本文目的和核心贡献（明确的1-2句）

Methods（方法）应包含：
- 研究设计/实验设置（完整可重复）
- 数据来源和预处理
- 模型/算法描述（含超参数）
- 评价指标定义

Results（结果）应包含：
- 主要结果（先陈述，后数据）
- 对比基线和消融实验
- 图表所有panel的文字描述

Discussion（讨论）应包含：
- 主要发现的解释（与假设对比）
- 与现有文献的关联
- 局限性（诚实列举）
- 未来方向

请对照以上标准逐节检查，给出具体缺失和改进建议
```

### CONSORT 2025 合规检查（RCT）
```
你是CONSORT 2025专家，对这篇随机对照试验（RCT）论文进行合规检查：

必须核查的25条目（重点检查以下高风险项）：
1a. 标题是否包含"randomised"关键词？
4a. 合格标准（纳入/排除）是否明确定义？
6a. 主要/次要结局指标是否在方法中预先说明？
7a. 样本量如何计算（含依据和参数）？
8a. 随机序列如何生成（方法和类型）？
9. 分配隐藏机制是否描述？（非随机化本身，而是隐藏机制）
10. 谁执行随机化？
11a. 是否说明盲法（参与者/执行者/评估者）？如无盲法，理由？
13a. 是否附CONSORT流程图（筛查→随机→分析人数）？
16. 每组分析人数（分母）是否与随机化人数一致？
17a. 主要结局是否报告效应量+95% CI？
22. 是否登记（临床试验注册号和注册时间）？

逐条标注：✅ 合规 / ⚠️ 部分合规（具体说明） / ❌ 缺失（补充建议）
生成CONSORT合规报告word
```

### PRISMA 2020 合规检查（系统综述/Meta分析）
```
你是PRISMA 2020专家，对这篇系统综述/Meta分析进行合规检查：

重点核查条目：
3. 是否提供完整检索策略（至少一个数据库的全文）？
6. 是否说明排重方法？
7. 是否描述文献筛选流程（初筛/全文审阅人数及分歧处理）？
8. 是否有PRISMA 2020流程图（4层：识别→筛查→合格→纳入）？
9. 是否记录排除原因（全文排除阶段）？
13a. 主要Meta分析是否报告各研究效应量+95%CI+异质性I²？
13b. 是否附森林图（Forest plot）？
15. 是否进行偏倚风险评估（说明使用的工具）？
16. 是否进行发表偏倚评估（漏斗图或Egger检验）？
17. 是否进行敏感性分析？
21. 是否注册（PROSPERO或类似平台，注明注册号）？

逐条标注：✅ / ⚠️ / ❌，并给出缺失内容的补充模板
生成PRISMA合规报告word
```

### STROBE 合规检查（观察性研究）
```
你是STROBE专家，对这篇[队列研究/病例对照研究/横断面研究]进行合规检查：

重点核查条目：
1. 标题或摘要是否标明研究设计类型？
4. 研究设置（地点、时间、背景）是否清晰？
6. 暴露变量（队列/横断面）或病例/对照定义（病例对照）是否明确？
7. 结局指标和暴露的测量方法是否描述？
9. 偏倚来源（选择偏倚、信息偏倚、混杂）是否讨论？
12a. 连续变量是否报告均数±SD或中位数(IQR)？
12b. 是否报告缺失数据的处理方法？
12e. 队列研究：失访原因和人数是否报告？
16. 混杂因素调整策略（多变量模型变量选择依据）是否说明？

逐条标注：✅ / ⚠️ / ❌，给出补充建议
生成STROBE合规报告word
```

### ARRIVE 2.0 合规检查（动物实验）
```
你是ARRIVE 2.0专家，对这篇动物实验论文进行合规检查：

必要条目（Essential 10）重点核查：
1. 是否说明动物实验伦理批准（机构+批准号）？
2. 研究设计是否随机化（如何分组，是否盲法）？
3. 样本量如何确定（幂分析或文献依据）？
4. 是否报告排除动物数量和原因？
5. 所有结局指标是否在引言/方法中预先说明？
6. 统计方法是否完整（含使用的软件和版本）？
7. 实验动物的所有特征是否描述（品系/性别/年龄/体重/健康状态）？
8. 实验环境（饲养条件、光照周期）是否报告？
9. 每组实际分析动物数是否明确（分母一致性）？
10. 是否提供每只动物的原始数据或汇总统计（均数±SEM/SD）？

逐条标注：✅ / ⚠️ / ❌，给出缺失内容的补充建议
生成ARRIVE合规报告word
```

### 一键识别适用报告规范
```
根据这篇论文的研究设计，帮我确定应该使用哪个报告规范：

请分析：
1. 研究类型是什么（RCT/观察性/Meta分析/动物实验/病例报告/方法类）？
2. 适用的报告规范是什么（CONSORT/STROBE/PRISMA/ARRIVE/CARE/IMRAD）？
3. 目标期刊[期刊名]是否强制要求提交规范对照表？
4. 需要额外附上哪些材料（CONSORT流程图/PRISMA流程图/注册号）？

给出明确的规范选择建议和投稿时需要准备的checklist材料清单
```

### 方法部分可重复性审查
```
你是实验可重复性审查员，对这篇论文的方法部分进行审查：

检查以下可重复性要素：
1. 所有试剂/材料是否有厂商、货号、批号？
2. 所有仪器是否有型号、参数设置？
3. 所有软件是否有版本号和参数？
4. 统计方法：使用的检验名称、显著性阈值（α）、多重比较校正方法？
5. 样本量：每组n是多少？如有排除，理由和数量？
6. 时间点/剂量：是否精确描述？
7. 代码/数据：是否提供可访问的链接或accession number？

逐条标注，给出具体补充内容，生成可重复性审查报告word
```

---

## 17. 期刊优先策略

在写论文之前，先确定目标期刊。期刊决定了你的写作深度、图表标准、字数限制和论证框架。"先写后选刊"会导致大量返工。

> 详细提示词见伴侣模块：[`journal-strategy.md`](journal-strategy.md)

### 快速期刊选择（写作前）
```
我有一篇[方法类/应用类/综述类/临床类]论文，核心亮点是：
[一句话描述]

请推荐3个最匹配的目标期刊：
- 最高目标（冲刺）：[期刊名 + IF + 为何适合]
- 主要目标（最匹配）：[期刊名 + IF + 为何适合]
- 保底选择（高录用率）：[期刊名 + IF + 为何适合]

对主要目标期刊，给出：写这篇论文需要特别注意哪些格式和内容要求？
```

### FINER研究问题快速评分
```
请对我的研究问题进行FINER快速评分（各5分，满分25）：

研究问题：[明确描述，1-2句话]

F — Feasible（可行性）：[1-5分] [理由]
I — Interesting（重要性）：[1-5分] [理由]
N — Novel（新颖性）：[1-5分] [理由]
E — Ethical（伦理性）：[1-5分] [理由]
R — Relevant（相关性）：[1-5分] [理由]

总分：[X]/25

≥22：优秀，可直接写作
18-21：良好，建议强化低分维度
<18：建议修改研究问题后再写作

对低分维度给出具体改进建议
```

### 期刊风格校准卡
```
我计划投稿到[目标期刊名]，请基于该期刊的特点，生成"风格校准卡"：

分析该期刊：
1. 摘要结构（几段/几句/典型开头方式）
2. 引言逻辑（漏斗式/问题-解决，gap在第几段）
3. 结果表述（先数据还是先结论）
4. 语言风格（句长/语态/是否第一人称）
5. 引用密度（引言每段平均几条引用）
6. 特殊要求（structured abstract/数据共享/代码开源）

输出：一页风格校准卡，供写作时参考
```

---

## 18. 引用诚信核查

AI辅助写作存在引用幻觉风险（2026年研究发现14.6万条幻觉引用）。投稿前必须核查引用真实性。

> 详细提示词见伴侣模块：[`citation-integrity.md`](citation-integrity.md)

### 引用幻觉扫描（投稿前必做）
```
请对我这篇论文的参考文献进行幻觉风险扫描：

重点检查：
1. 期刊名称是否为真实期刊（无异常拼写/杜撰期刊名）？
2. 作者姓名格式是否正常（无随机字符）？
3. 年份与卷期号是否匹配？
4. DOI格式是否合法（10.XXXX/YYYY格式）？
5. 被引内容是否真的支持对应的论点（而非仅主题相关）？

对每条可疑引用标注：
🔴 高风险（可能幻觉）/ 🟡 中风险（需手动核实）/ 🟢 低风险

[粘贴参考文献列表]
```

### Trust-Chain核心论点溯源
```
请为我论文的核心论点建立Trust-Chain（证据链）：

论点：[你最重要的声明，1-2句话]
支撑引用：[引用信息]

三层核查：
层1 — 引用真实性：该文献是否真实存在？
层2 — 原文匹配：原文是否真的说了这个论点？（请引用原文段落）
层3 — 逻辑一致：我的声明与原文结论是否一致，还是存在过度解读？

结论：✅ 证据链完整 / ⚠️ 需要补强（说明差距）/ ❌ 引用不支持论点（建议替换）
```

---

## 19. 质量门控自评

论文投稿前，用7维度35分框架进行结构化自评。**≥28/35 方可提交**，<28 需定向改进。

> 详细提示词和R&R可追溯矩阵见伴侣模块：[`quality-gates.md`](quality-gates.md)

### 7维度35分快速自评
```
请对这篇论文进行7维度质量评估（各5分）：

1. 原创性（Originality）：[1-5分] [理由]
2. 论证质量（Argumentation）：[1-5分] [理由]
3. 文献覆盖（Literature Coverage）：[1-5分] [理由]
4. 方法严谨性（Methodological Rigor）：[1-5分] [理由]
5. 语言清晰度（Clarity）：[1-5分] [理由]
6. 学术影响（Academic Impact）：[1-5分] [理由]
7. 技术准确性（Technical Accuracy）：[1-5分] [理由]

总分：[X]/35

≥28 ✅ 可投稿 / 24-27 ⚠️ 需改进 / <24 ❌ 重大修改

对得分≤3的维度给出具体改进建议
```

### R&R修订可追溯矩阵（返修必用）
```
请生成R&R修订可追溯矩阵，核查我声称的修改是否真实存在：

| 意见编号 | 审稿人意见 | 我声称的修改 | 修改位置 | 真实存在？ | 是否响应意见？|
|---------|----------|------------|---------|----------|------------|
| R1.1 | [意见] | [修改] | [位置] | ✅/❌ | ✅/⚠️/❌ |

[粘贴审稿意见 + 回复信 + 修订稿相关段落]

对❌/⚠️项给出修复方案
```

---

## 20. CRediT作者贡献声明

CRediT（Contributor Roles Taxonomy）是ICMJE和多数顶刊现在要求的标准化作者贡献声明格式，包含14个标准角色。

### CRediT声明生成
```
请根据以下信息，生成符合CRediT规范的作者贡献声明：

作者列表及贡献：
- 作者A（通讯作者）：负责了[具体工作]
- 作者B：负责了[具体工作]
- 作者C：负责了[具体工作]
- 作者D：负责了[具体工作]

CRediT 14个标准角色（每位作者对应哪些）：
1. Conceptualization（概念化/研究思路提出）
2. Data curation（数据整理/管理）
3. Formal analysis（统计/数学分析）
4. Funding acquisition（资金获取）
5. Investigation（实验执行/数据收集）
6. Methodology（研究方法设计）
7. Project administration（项目管理）
8. Resources（资源提供，如仪器/材料/数据）
9. Software（代码开发/编程）
10. Supervision（监督指导）
11. Validation（验证结果可重复性）
12. Visualization（数据可视化/图表制作）
13. Writing – original draft（原稿写作）
14. Writing – review & editing（审阅与修改）

输出格式（Nature/Elsevier标准）：
"[作者A]: Conceptualization, Methodology, Writing – original draft, Supervision. [作者B]: Software, Validation, Visualization. ..."

注意：每位作者至少有1个角色；通讯作者通常有Conceptualization和Supervision
```

### CRediT声明语言润色
```
请将以下CRediT声明润色为期刊发表标准：

原始声明：
[粘贴你的初始描述]

要求：
1. 使用CRediT标准的14个角色名称（不要自创角色名）
2. 按作者顺序（通讯作者放最后或标注*）
3. 每位作者的角色用逗号分隔，作者间用句号分隔
4. 语言简洁，不添加额外解释

输出标准格式的CRediT声明
```

---

## 21. 伦理声明、利益冲突与预印本

这三类声明在顶刊投稿中越来越重要，缺少会直接导致退稿或重大修改。

### 伦理声明起草
```
请帮我起草这篇论文的伦理声明：

研究类型：[人体研究/动物实验/数据研究/纯算法研究]

我的伦理情况：
- 伦理审批机构：[机构名称，如：XX大学医学伦理委员会]
- 审批编号：[编号，如：XXIRBXXXXXX，或"待获取"（标注[AUTHOR_INPUT_NEEDED]）]
- 是否涉及人体受试者：[是/否]
- 是否获得知情同意：[是/否/豁免（说明原因）]
- 是否涉及动物实验：[是/否]
- 数据是否为公开匿名数据（无需伦理审批）：[是/否]

输出：
1. 中文版伦理声明（用于国内期刊）
2. 英文版伦理声明（用于SCI/国际期刊，符合[目标期刊]要求）
3. 若信息不完整，用[AUTHOR_INPUT_NEEDED: xxx]标注缺失项
```

### 利益冲突声明（COI）
```
请帮我起草这篇论文的利益冲突声明（Conflict of Interest Statement）：

情况：[以下选择/描述实际情况]
- 所有作者均无利益冲突
- 资助方：[资金来源，如：国家自然科学基金NSFC No.XXXXXXXX]
- 是否与商业公司有合作：[是/否]
- 是否持有相关专利：[是/否]
- 是否为期刊编委：[是/否]

目标期刊：[期刊名]（不同期刊COI格式略有不同）

输出：符合[目标期刊]要求的利益冲突声明标准格式
```

### 资金致谢（Funding/Acknowledgement）
```
请帮我生成资金支持致谢部分：

资金来源：
- [基金名称 + 批准号 + 资助作者姓名]
- [例：国家自然科学基金 No.62373123（陈X）]
- [例：National Natural Science Foundation of China (NSFC) under Grant 62373123]

其他致谢（可选）：
- 计算资源：[如：感谢XX大学HPC中心]
- 数据来源：[如：感谢XX数据库提供公开数据集]
- 技术支持：[如有]

输出：中英文两版致谢，格式符合[目标期刊]要求
```

### 预印本工作流（arXiv/bioRxiv）
```
我计划在投稿前/同时将论文上传到预印本服务器。请指导：

预印本平台选择：
- arXiv：适合 CS/数学/物理/统计/电气工程 → 分类建议：[cs.XX / eess.XX / stat.XX]
- bioRxiv：适合生命科学/生物医学
- medRxiv：适合临床/公共卫生
- SSRN：适合社会科学/经济/法律

我的论文方向：[领域]

请告诉我：
1. 推荐上传哪个预印本平台？具体分类（category）？
2. 目标期刊[期刊名]是否允许预印本（Sherpa/RoMEO政策）？
3. 上传预印本时需要准备哪些内容（标题/作者/摘要/PDF/关键词）？
4. 预印本上传后，在论文中如何引用自己的预印本？
5. 期刊接收后，是否需要在预印本页面更新发表信息？

给出完整的预印本发布流程
```

### AI辅助声明
```
越来越多期刊要求作者声明是否使用了AI写作工具（如ChatGPT/Codex/Grammarly等）。

请帮我起草AI使用声明：

我使用AI的情况：
- 是否使用AI生成文字：[是（哪些部分）/否]
- 是否使用AI修改语言/润色：[是/否]
- 是否使用AI辅助代码：[是/否]
- 是否使用AI辅助分析数据：[是/否]
- 使用的工具：[Codex/ChatGPT/Grammarly/其他]

目标期刊[期刊名]的AI声明政策：
- Nature系列：要求在Methods中声明
- Elsevier：需在Author Statement中填写
- IEEE：目前建议但不强制

输出：符合[目标期刊]政策要求的AI使用声明（若无需声明也说明原因）
```

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## Common Mistakes

- **忘记识别论文类型**：不同类型（discovery/methods/review）叙事结构不同，先识别类型再写作
- **写完再选刊**：应该先选好目标期刊再写作，否则风格、深度、格式均可能需要大改
- **引用未核查就投稿**：AI幻觉引用是退稿常见原因之一，务必使用citation-integrity.md核查
- **审稿回复编造修改**：不要声称做了实验或修改却没有对应的论文位置，用`[作者需提供：XXX]`占位
- **忽略CRediT声明**：Nature/Elsevier/Springer期刊均要求CRediT，缺少会退回要求补充
- **提示词太短**：审稿类需明确"不补实验的基础上"、"生成word在桌面上"等约束
- **忘记指定输出格式**：每次说清楚生成word/latex/pdf，以及生成到哪个路径
- **LaTeX修订不精确**：要加"精确告诉我修改哪一行，修改前后对比"，否则找不到修改位置
- **绘图前未定图表合同**：先回答"这图证明什么"再绘图，否则容易做出与文章脱节的图
- **翻译后未校对**：中译英后必须做"修改前标蓝，修改后标红"的对比校对
- **不做质量门控直接投稿**：使用quality-gates.md确保≥28/35再提交，低分强投成功率极低

