# Scientific Latex Formatter > Markdown 原稿を LaTeX 形式に変換し、ジャーナル指定のテンプレート（.cls/.sty）に 適合するフォーマッティングを行うスキル。数式・図表・引用・相互参照の LaTeX 構文変換、 ジャーナル別スタイル適用、コンパイル可能な .tex ファイル生成を担う。 「LaTeX に変換して」「投稿用 TeX を作って」「ジャーナルフォーマットにして」で発火。 - Skill: `nahisaho/scientific-latex-formatter-2` (Agent Skill) - Install (CLI): `npx skillmds@latest add nahisaho/scientific-latex-formatter-2` - Raw SKILL.md: https://api.skillmd.com/api/skills/nahisaho/scientific-latex-formatter-2/raw - Safety review: pending - Works with: Claude Code, Claude.ai, OpenAI Codex - Category: Docs & Writing - Author: nahisaho (https://skillmd.com/u/nahisaho) - Updated: 2026-09-21 - Page: https://skillmd.com/skills/nahisaho/scientific-latex-formatter-2 --- # Scientific LaTeX Formatter Markdown 原稿を LaTeX に変換し、ジャーナル指定テンプレートに適合する 投稿用 .tex ファイルを生成するスキル。 ## When to Use - Markdown で執筆した原稿を LaTeX 形式に変換するとき - ジャーナル指定の LaTeX テンプレート（revtex4, elsarticle 等）に合わせるとき - 数式・図表・参照の LaTeX 構文を正確に生成したいとき - 投稿用の .tex + .bib + figures/ 一式を準備するとき - Supplementary Information も LaTeX で整形するとき ## Quick Start ## 1. 変換ワークフロー ``` Markdown 原稿 (manuscript/manuscript.md) ├─ Phase 1: Markdown → LaTeX 基本変換 │ ├─ セクション見出し (#, ##, ###) → \section, \subsection │ ├─ 太字・斜体 → \textbf, \textit │ ├─ リスト → \begin{itemize/enumerate} │ └─ コードブロック → \begin{lstlisting} or verbatim ├─ Phase 2: 学術要素の変換 │ ├─ 図の埋め込み → \begin{figure}...\includegraphics │ ├─ 表 → \begin{table}...\begin{tabular} │ ├─ 数式 ($...$, $$...$$) → \( \), \[ \], equation 環境 │ ├─ 引用 [1], [2-5] → \cite{key1}, \cite{key1,key2,...} │ └─ 相互参照 (Figure 1, Table 2) → \ref{fig:1}, \ref{tab:2} ├─ Phase 3: ジャーナルテンプレート適用 │ ├─ documentclass の設定 │ ├─ タイトル・著者・所属の構造化 │ ├─ Abstract 環境の適用 │ └─ 参考文献スタイル (bibliographystyle) の設定 └─ Phase 4: ファイル出力 ├─ manuscript/manuscript.tex ├─ manuscript/references.bib └─ manuscript/figures/ (コピー) ``` ## 2. ジャーナル別 LaTeX テンプレート ```python JOURNAL_TEMPLATES = { "nature": { "documentclass": r"\documentclass{nature}", "packages": [ r"\usepackage{graphicx}", r"\usepackage{amsmath}", r"\usepackage{natbib}", ], "bib_style": "naturemag", "figure_width": r"0.8\textwidth", "abstract_env": "abstract", "title_cmd": r"\title{%s}", "author_cmd": r"\author{%s}", "affiliation_cmd": r"\affiliation{%s}", }, "science": { "documentclass": r"\documentclass[12pt]{article}", "packages": [ r"\usepackage{graphicx}", r"\usepackage{amsmath}", r"\usepackage[numbers,sort&compress]{natbib}", r"\usepackage{setspace}", r"\doublespacing", ], "bib_style": "Science", "figure_width": r"0.9\textwidth", "abstract_env": "abstract", "title_cmd": r"\title{%s}", "author_cmd": r"\author{%s}", "affiliation_cmd": None, }, "acs": { "documentclass": r"\documentclass[journal=jacsat,manuscript=article]{achemso}", "packages": [ r"\usepackage{graphicx}", r"\usepackage{amsmath}", ], "bib_style": "achemso", "figure_width": r"3.25in", "abstract_env": "abstract", "title_cmd": r"\title{%s}", "author_cmd": r"\author{%s}", "affiliation_cmd": r"\affiliation{%s}", }, "ieee": { "documentclass": r"\documentclass[conference]{IEEEtran}", "packages": [ r"\usepackage{graphicx}", r"\usepackage{amsmath}", r"\usepackage{cite}", ], "bib_style": "IEEEtran", "figure_width": r"\columnwidth", "abstract_env": "abstract", "title_cmd": r"\title{%s}", "author_cmd": r"\author{%s}", "affiliation_cmd": None, }, "elsevier": { "documentclass": r"\documentclass[preprint,12pt]{elsarticle}", "packages": [ r"\usepackage{graphicx}", r"\usepackage{amsmath}", r"\usepackage{lineno}", r"\modulolinenumbers[5]", ], "bib_style": "elsarticle-num", "figure_width": r"\textwidth", "abstract_env": "abstract", "title_cmd": r"\title{%s}", "author_cmd": r"\author{%s}", "affiliation_cmd": r"\address{%s}", }, "revtex": { "documentclass": r"\documentclass[aps,prl,twocolumn,superscriptaddress]{revtex4-2}", "packages": [ r"\usepackage{graphicx}", r"\usepackage{amsmath}", ], "bib_style": "apsrev4-2", "figure_width": r"\columnwidth", "abstract_env": "abstract", "title_cmd": r"\title{%s}", "author_cmd": r"\author{%s}", "affiliation_cmd": r"\affiliation{%s}", }, } ``` ## 3. Markdown → LaTeX 変換エンジン ```python import re from pathlib import Path def md_to_latex(md_text, journal_format="elsevier"): """ Markdown テキストを LaTeX に変換する。 Args: md_text: str — Markdown 原稿テキスト journal_format: str — ジャーナル形式 Returns: str: LaTeX テキスト """ tex = md_text # === セクション見出し === tex = re.sub(r'^### (.+)$', r'\\subsubsection{\1}', tex, flags=re.MULTILINE) tex = re.sub(r'^## (.+)$', r'\\subsection{\1}', tex, flags=re.MULTILINE) tex = re.sub(r'^# (.+)$', r'\\section{\1}', tex, flags=re.MULTILINE) # === インライン書式 === tex = re.sub(r'\*\*\*(.+?)\*\*\*', r'\\textbf{\\textit{\1}}', tex) tex = re.sub(r'\*\*(.+?)\*\*', r'\\textbf{\1}', tex) tex = re.sub(r'\*(.+?)\*', r'\\textit{\1}', tex) # === 数式 === # ディスプレイ数式 $$...$$ → \[ \] (equation 環境にラベルが必要な場合は手動) tex = re.sub(r'\$\$(.+?)\$\$', r'\\[\1\\]', tex, flags=re.DOTALL) # インライン数式は LaTeX でもそのまま使える ($...$) # === 図の埋め込み === tex = _convert_figures(tex, journal_format) # === 表の変換 === tex = _convert_tables(tex) # === 引用の変換 === # [1] → \cite{ref1}, [1, 2] → \cite{ref1,ref2}, [1-3] → \cite{ref1,ref2,ref3} tex = re.sub(r'\[(\d+(?:[-,\s]\d+)*)\]', _convert_citation, tex) # === 箇条書きの変換 === tex = _convert_lists(tex) # === 特殊文字エスケープ === # & と % はすでに LaTeX 構文で使っている場合があるので慎重に tex = tex.replace('&', r'\&') tex = tex.replace('%', r'\%') return tex def _convert_figures(tex, journal_format): """Markdown の図埋め込みを LaTeX figure 環境に変換する。""" tmpl = JOURNAL_TEMPLATES.get(journal_format, JOURNAL_TEMPLATES["elsevier"]) fig_width = tmpl["figure_width"] def fig_replacer(m): alt_text = m.group(1) img_path = m.group(2) # ファイル名から拡張子を除去 (LaTeX は拡張子なしでも可) img_base = Path(img_path).stem # Figure 番号を alt_text から抽出 fig_num = re.search(r'(\d+)', alt_text) label = f"fig:{fig_num.group(1)}" if fig_num else f"fig:{img_base}" return ( f"\\begin{{figure}}[htbp]\n" f" \\centering\n" f" \\includegraphics[width={fig_width}]{{{img_path}}}\n" f" \\caption{{{alt_text}}}\n" f" \\label{{{label}}}\n" f"\\end{{figure}}" ) tex = re.sub(r'!\[([^\]]*)\]\(([^)]+)\)', fig_replacer, tex) return tex def _convert_tables(tex): """Markdown テーブルを LaTeX tabular 環境に変換する。""" lines = tex.split('\n') result = [] in_table = False table_lines = [] for line in lines: if re.match(r'^\|.*\|$', line.strip()): if not in_table: in_table = True table_lines = [] table_lines.append(line.strip()) else: if in_table: result.append(_table_to_latex(table_lines)) in_table = False table_lines = [] result.append(line) if in_table: result.append(_table_to_latex(table_lines)) return '\n'.join(result) def _table_to_latex(table_lines): """Markdown テーブル行のリストを LaTeX tabular に変換する。""" # ヘッダー行 headers = [c.strip() for c in table_lines[0].strip('|').split('|')] n_cols = len(headers) col_spec = '|' + '|'.join(['c'] * n_cols) + '|' latex = [ r"\begin{table}[htbp]", r" \centering", f" \\begin{{tabular}}{{{col_spec}}}", r" \hline", " " + " & ".join(f"\\textbf{{{h}}}" for h in headers) + r" \\", r" \hline", ] # データ行（セパレータ行 |---|---| をスキップ） for line in table_lines[2:]: cells = [c.strip() for c in line.strip('|').split('|')] latex.append(" " + " & ".join(cells) + r" \\") latex.extend([ r" \hline", r" \end{tabular}", r" \caption{[テーブルのキャプション]}", r" \label{tab:label}", r"\end{table}", ]) return '\n'.join(latex) def _convert_citation(m): """引用番号を \\cite{} 形式に変換する。""" raw = m.group(1) # "1-3" → "ref1,ref2,ref3", "1, 2" → "ref1,ref2" nums = [] for part in re.split(r'[,\s]+', raw): if '-' in part: start, end = part.split('-') nums.extend(range(int(start), int(end) + 1)) else: nums.append(int(part)) keys = ','.join(f"ref{n}" for n in sorted(set(nums))) return f"\\cite{{{keys}}}" def _convert_lists(tex): """Markdown リストを LaTeX 環境に変換する。""" lines = tex.split('\n') result = [] in_list = False list_type = None for line in lines: ul_match = re.match(r'^(\s*)[-*]\s+(.+)$', line) ol_match = re.match(r'^(\s*)\d+\.\s+(.+)$', line) if ul_match and not in_list: in_list = True list_type = "itemize" result.append(r"\begin{itemize}") result.append(f" \\item {ul_match.group(2)}") elif ul_match and in_list and list_type == "itemize": result.append(f" \\item {ul_match.group(2)}") elif ol_match and not in_list: in_list = True list_type = "enumerate" result.append(r"\begin{enumerate}") result.append(f" \\item {ol_match.group(2)}") elif ol_match and in_list and list_type == "enumerate": result.append(f" \\item {ol_match.group(2)}") else: if in_list: result.append(f"\\end{{{list_type}}}") in_list = False list_type = None result.append(line) if in_list: result.append(f"\\end{{{list_type}}}") return '\n'.join(result) ``` ## 4. 完全な .tex ファイル生成 ```python def generate_tex_file(manuscript_path, journal_format="elsevier", title="", authors="", affiliations="", abstract_text="", keywords=None, filepath=None): """ Markdown 原稿から完全な .tex ファイルを生成する。 Args: manuscript_path: Path — 入力 Markdown ファイル journal_format: str — ジャーナル形式 title, authors, affiliations: str — メタデータ abstract_text: str — アブストラクト keywords: list[str] — キーワード filepath: Path — 出力先（デフォルト: manuscript/manuscript.tex） """ from pathlib import Path if filepath is None: filepath = BASE_DIR / "manuscript" / "manuscript.tex" filepath.parent.mkdir(parents=True, exist_ok=True) tmpl = JOURNAL_TEMPLATES.get(journal_format, JOURNAL_TEMPLATES["elsevier"]) # Markdown 本文を読み込み・変換 with open(manuscript_path, "r", encoding="utf-8") as f: md_text = f.read() body_tex = md_to_latex(md_text, journal_format) # プリアンブル構築 preamble = [tmpl["documentclass"]] preamble.extend(tmpl["packages"]) preamble.append("") # タイトル・著者 doc_begin = [r"\begin{document}", ""] if title: doc_begin.append(tmpl["title_cmd"] % title) if authors: doc_begin.append(tmpl["author_cmd"] % authors) if affiliations and tmpl.get("affiliation_cmd"): doc_begin.append(tmpl["affiliation_cmd"] % affiliations) doc_begin.append(r"\maketitle") # アブストラクト if abstract_text: doc_begin.extend([ "", f"\\begin{{{tmpl['abstract_env']}}}", abstract_text, f"\\end{{{tmpl['abstract_env']}}}", ]) # キーワード if keywords: doc_begin.extend([ "", r"\begin{keyword}", " \\sep ".join(keywords), r"\end{keyword}", ]) # ドキュメント末尾 doc_end = [ "", f"\\bibliographystyle{{{tmpl['bib_style']}}}", r"\bibliography{references}", "", r"\end{document}", ] # 結合 full_tex = '\n'.join(preamble) + '\n' + '\n'.join(doc_begin) + '\n\n' full_tex += body_tex + '\n' full_tex += '\n'.join(doc_end) + '\n' with open(filepath, "w", encoding="utf-8") as f: f.write(full_tex) print(f" → LaTeX ファイルを保存: {filepath}") return filepath ``` ## 5. BibTeX ファイル生成 ```python def generate_bib_file(references, filepath=None): """ 引用リストから BibTeX ファイルを生成する。 Args: references: list[dict] — 各参照のメタデータ [{"key": "ref1", "type": "article", "author": "...", "title": "...", "journal": "...", "year": "...", ...}] filepath: Path — 出力先（デフォルト: manuscript/references.bib） """ from pathlib import Path if filepath is None: filepath = BASE_DIR / "manuscript" / "references.bib" filepath.parent.mkdir(parents=True, exist_ok=True) content = "" for ref in references: ref_type = ref.get("type", "article") key = ref.get("key", "unknown") fields = [] for field_name in ["author", "title", "journal", "year", "volume", "number", "pages", "doi", "publisher", "booktitle", "url", "note"]: if field_name in ref and ref[field_name]: fields.append(f" {field_name} = {{{ref[field_name]}}}") content += f"@{ref_type}{{{key},\n" content += ",\n".join(fields) content += "\n}\n\n" with open(filepath, "w", encoding="utf-8") as f: f.write(content) print(f" → BibTeX ファイルを保存: {filepath} ({len(references)} 件)") return filepath ``` ## 6. LaTeX 変換パイプライン統合 ```python def run_latex_pipeline(manuscript_path, journal_format="elsevier", title="", authors="", affiliations="", abstract_text="", keywords=None, references=None): """ Markdown → LaTeX 変換パイプラインを実行する。 出力ファイル: manuscript/manuscript.tex — メイン LaTeX ファイル manuscript/references.bib — BibTeX 参照データベース """ print("=" * 60) print("LaTeX Formatter Pipeline") print("=" * 60) # Phase 1-3: Markdown → LaTeX 変換 + テンプレート適用 print("\n[Phase 1-3] Markdown → LaTeX 変換...") tex_path = generate_tex_file( manuscript_path, journal_format=journal_format, title=title, authors=authors, affiliations=affiliations, abstract_text=abstract_text, keywords=keywords, ) # Phase 4: BibTeX 生成 if references: print("\n[Phase 4] BibTeX ファイル生成...") generate_bib_file(references) print("\n" + "=" * 60) print("LaTeX 変換完了！") print(f" コンパイル: pdflatex manuscript.tex && bibtex manuscript && pdflatex manuscript.tex × 2") print("=" * 60) return tex_path ``` ## ToolUniverse 連携 | TU Key | ツール名 | 連携内容 | |--------|---------|--------| | `crossref` | Crossref | 参考文献メタデータ・DOI 解決 | ## References ### Output Files | ファイル | 形式 | 生成タイミング | |---|---|---| | `manuscript/manuscript.tex` | LaTeX メインファイル | 変換完了時 | | `manuscript/references.bib` | BibTeX 参照データベース | 変換完了時 | ### 対応ジャーナルテンプレート | テンプレート | documentclass | bib_style | |---|---|---| | Nature 系 | `nature` | `naturemag` | | Science 系 | `article` (12pt) | `Science` | | ACS 系 | `achemso` | `achemso` | | IEEE 系 | `IEEEtran` | `IEEEtran` | | Elsevier 系 | `elsarticle` | `elsarticle-num` | | APS/PRL 系 | `revtex4-2` | `apsrev4-2` | ### 参照スキル | スキル | 連携 | |---|---| | `scientific-academic-writing` | 入力: `manuscript/manuscript.md` (Markdown 原稿) | | `scientific-supplementary-generator` | SI の LaTeX 変換にも対応 | | `scientific-citation-checker` | 引用キーの整合性を検証後に BibTeX 生成 | | `scientific-publication-figures` | `figures/` の図パスを `\includegraphics` に変換 | ```