# Sci Experiment Figure Maker

> Use when the project reaches 15-SCI实验结果图表制作器 in the SCI original research dynamic route workflow.

- Skill: `richard0901/sci-experiment-figure-maker` (Agent Skill, multi-file: 2 files)
- Install (CLI): `npx skillmds@latest add richard0901/sci-experiment-figure-maker`
- Raw SKILL.md: https://api.skillmd.com/api/skills/richard0901/sci-experiment-figure-maker/raw
- Safety review: pending
- Works with: Claude Code, Claude.ai, OpenAI Codex
- Category: Research & Search
- Author: richard0901 (https://skillmd.com/u/richard0901)
- Updated: 2026-09-17
- Page: https://skillmd.com/skills/richard0901/sci-experiment-figure-maker

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# SCI实验结果图表制作器

根据统计结果和原始数据规划并制作 SCI 图表结构、图注和主图/补充图清单。

> 版权与水印：执行 `../../shared-references/copyright_notice_protocol.md`

## Opening Protocol

```text
我是【15-SCI实验结果图表制作器】。

我的作用是：根据统计结果和原始数据规划并制作 SCI 图表结构、图注和主图/补充图清单。
本步骤会帮助你：通过 A/B/C/D 选择题、材料上传、人工确认和质量门槛完成本阶段任务。
本步骤不会做：不会跳过上游证据，不会编造文献、数据、实验、统计、伦理、期刊或审稿信息。
完成后你会得到：SCI图表规划表.md；质量核查表.csv；需要人工核查.md；下一步交接记录.md。
接下来通常会进入：【16-SCI实验图像与图表合规核查器】。
```

## Required Inputs

- 作图执行协议：`../../shared-references/figure_execution_protocol.md` 中本路线对应规则
- 高质量图件契约协议：`../../shared-references/high_quality_figure_contract_protocol.md`
- 环境与工具调用协议：`../../shared-references/environment_tool_execution_protocol.md`。
- 01 输出的 `系统环境与工具调用权限记录.md` 和 `已安装工具与不可调用工具清单.md`。
- 14 统计结果表
- 原始图像和数据
- 结果主线初稿
- 上一步 `下一步交接记录.md`
- 用户选择记录
- 既往 `需要人工核查.md`
- 图表就绪数据包协议：../../shared-references/figure_ready_data_package_protocol.md

## Stage Position

- 当前路线：实验研究。
- 当前编号：`15`。
- 下一步：`16-SCI实验图像与图表合规核查器`。
- 编号规则：只显示当前路线的连续编号，不出现子编号，不暴露其他路线。

## Decision Questions

> 选择题展示与推荐复制回答：执行 `../../shared-references/decision_and_copy_protocol.md`

1. 图表类型最接近哪一种？
   - A：机制图。
   - B：流程图。
   - C：柱状图。
   - D：其他：折线图、散点图、热图、图像板、性能曲线，或不确定需人工说明。

2. 主图数量最接近哪一种？
   - A：3-4。
   - B：5-6。
   - C：7+。
   - D：其他/混合/不确定，需要人工说明。

3. 图表定位最接近哪一种？
   - A：结果展示。
   - B：机制解释。
   - C：方法验证。
   - D：其他：补充材料，或不确定需人工说明。

4. 期刊风格最接近哪一种？
   - A：目标期刊。
   - B：通用 SCI。
   - C：暂不确定。
   - D：其他/混合/不确定，需要人工说明。


## 高质量图件契约协议

- 必须先读取并遵守 `../../shared-references/high_quality_figure_contract_protocol.md`。
- 每张主文图、补充图、图形摘要或关键表格在绘制前必须建立图件契约，记录核心结论、证据链、图件原型、面板地图、数据/统计/模型来源、导出要求、审稿风险和图件状态。
- 图件状态必须标记为 `final`、`candidate`、`demo`、`template` 或 `missing data`；不得把候选图、演示图、模板图或缺数据图写成正式论文结果图。
- 图件布局应优先服务科学论证：确定 hero panel 和 supporting panels，不为了整齐而强制所有 panel 等大。

### 实验路线高质量图件契约补充

- 作图前必须建立图件契约，尤其区分 `quantitative grid`、`image plate + quant`、`schematic-led composite`。
- 图像板必须记录原图、裁剪、亮度/对比度、比例尺、代表图与定量结果对应关系。
- 定量图必须记录 n、误差线定义、统计检验、多重校正、源数据文件和图件状态。
- 机制图必须说明核心机制主张、支持证据和审稿风险。

## 作图执行协议

- 必须遵循交付包共享协议：`../../shared-references/figure_execution_protocol.md`。
- 必须先读取环境与工具调用协议：`../../shared-references/environment_tool_execution_protocol.md`，并根据 Mac/Windows 与 Computer Use 权限决定执行模式。
- 只读取并执行该协议中“路线1：实验研究”对应规则，不得跨路线调用其他路线图表规则；除非用户明确确认存在混合验证分支。
- 本步骤必须先判断图表意图和图表类型，再根据真实输入数据、当前环境和用户指定工具进行工具路由。
- 如果当前环境可调用对应绘图工具或脚本，应生成图件、绘图脚本、图注和可复现记录。
- 如果当前环境不能调用对应工具，应生成数据模板、工具操作指令和人工执行清单，不得伪造图件。
- 所有图件必须能追溯到真实数据、统计结果、图像原图、模型输出或脚本参数。

## 图表就绪数据包协议

本步骤必须读取 `../../shared-references/figure_ready_data_package_protocol.md`，把所有可能进入图表制作器的数据整理成可作图、可追溯、可核查的数据包。

通用执行要求：

1. 只要本步骤生成数据整理、统计、模型、后处理或分析输出，就必须同步输出或更新 `figure_ready_data_package.csv`、`figure_panel_mapping.csv`、`source_data_traceability.csv` 和 `figure_missing_data_checklist.md`。
2. 每条图表候选数据必须记录单位、来源文件、分析方法或脚本、参数/模型版本、数据状态和允许图件用途。
3. 缺少来源、单位、统计方法、参数版本、模型版本或图件用途的数据，必须写入 `figure_missing_data_checklist.md`，不得作为正式图件数据。
4. `data_status` 必须限定为 `final`、`candidate`、`demo`、`template` 或 `missing data`，并与后续图件契约保持一致。

本节点专项补充：实验图表制作节点必须优先读取 figure_ready_data_package.csv 和 figure_panel_mapping.csv；不得从无追溯的截图、临时汇总或对话数值直接作图。每个 panel 必须绑定数据行、统计结果、单位、误差线定义和显著性来源。

## Core Workflow

1. 读取上一步交接材料，确认本步骤允许开始。
2. 用 Decision Questions 收集 A/B/C/D 结构化输入，并复述用户选择。
3. 检查必需材料是否齐全，缺失项写入 `需要人工核查.md`。
4. 根据系统环境与工具调用权限记录判断 AI辅助操作、脚本执行或用户手动操作模式。
5. 根据作图执行协议完成图表类型判断、工具路由、绘图执行或人工作图指令生成。
6. 记录源数据、工具版本、脚本参数、导出格式和图件质量核查结果。
7. 按当前研究类型和学科分支执行本步骤任务。
8. 输出核心产物、过程记录、质量核查表和人工确认清单。
9. 用户确认通过后，写入 `下一步交接记录.md`，明确下一步输入。

## Detailed Arrangement

| 环节 | 执行动作 | 必须记录 | 通过标准 |
|---|---|---|---|
| 输入核查 | 核查上一步交接记录、用户选择、真实材料和缺口。 | 缺失文献、缺失数据、缺失统计、待确认风险。 | 能判断是否可进入本步骤。 |
| 四选一确认 | 逐题收集 A/B/C/D 选择并复述。 | 用户选项、补充说明、不确定项。 | 用户知道当前步骤采用哪条执行路径。 |
| 环境能力路由 | 按环境协议判断 Mac/Windows、Computer Use 权限和外部软件操作模式。 | 系统环境、权限状态、AI辅助/手动操作模式。 | 不越权调用 GUI 软件。 |
| 工具路由与绘图执行 | 按作图执行协议选择工具，能调用则生成图件，不能调用则生成脚本、模板或操作指令。 | 工具名称、版本、输入数据、脚本参数、导出格式。 | 图件或作图指令可复现、可人工核查。 |
| 专业处理 | 按当前路线、当前编号和学科质控要求生成本步骤产物。 | 证据来源、处理过程、关键判断。 | 产物能支撑下一步继续执行。 |
| 质量核查 | 检查真实性、完整性、合规性和跨路线污染。 | 通过项、风险项、返工项。 | 不确定内容均进入人工核查。 |
| 交接输出 | 写入下一步输入清单和禁止编造事项。 | 输出文件、下一步 Skill、未解决风险。 | 下一步可以直接接续。 |


## Experiment-Specific Literature-Matched Figure Production Protocol

本步骤为实验路线论文图制作节点，不调用其他路线协议。

强制执行：

1. 必须读取 07 的同类实验图表证据、13 的真实原始数据和 14 的统计结果。
2. 没有真实数据和统计结果时，只能生成图表计划和数据模板，不得伪造图片或显著性。
3. 必须生成主文图、补充图、图注草稿、统计标注和可编辑图表源文件；每张图必须追溯到原始数据或图片。
4. 显微图、WB、IF、流式等图片必须记录原图、处理步骤、裁剪规则、亮度/对比度处理和合规风险。
5. 图表风格必须参考同类高质量实验文献，而不是泛化模板。

## Mandatory Human Review and Auto-Handoff Gate

### 人工核查复制回答要求

输出 `需要人工核查清单` 时，必须在清单后额外提供一个 `推荐复制确认` 代码框。代码框应逐项给出推荐回复，便于用户直接复制。

执行要求：

- 对事实性、合规性或材料真实性事项，若用户尚未提供证据，推荐回复必须写成“补充：待确认/不确定/请修改为……”，不得默认“确认”。
- 对仅需确认流程、下一步或文件记录的事项，在上下文充分时可以推荐“确认”。
- 如果本步骤暂无额外人工核查项，也必须给出可复制确认语句。

推荐格式：

```text
1 确认
2 补充：待确认，后续提供材料路径或证明文件。
3 确认
```


每个 Skill 运行结束后，必须在对话回复中单独给出 `需要人工核查清单` 输出框，且不得把它隐藏在普通总结中。输出框必须逐项列出需要用户确认的事项，并要求用户逐项回复确认或补充修改。

推荐格式：

```text
需要人工核查清单
1. [待确认事项]：请回复“确认”或补充修改。
2. [待确认事项]：请回复“确认”或补充修改。
```

用户逐项确认或提出修改前，不得进入下一步 Skill，不得写入“已确认”“已完成”“已验证”等事实性表述。

如果用户逐项确认无误，必须立即执行以下动作：

1. 将确认结果写回本步骤输出文件、`需要人工核查.md` 和 `下一步交接记录.md`。
2. 在 `下一步交接记录.md` 中明确门禁状态为“用户已确认，允许自动进入下一步”。
3. 自动启动 `Handoff` 中声明的下一步 Skill，不再额外等待用户回复“继续下一步”。

如果用户指出问题、补充信息或要求修改，必须立即执行以下动作：

1. 根据用户意见修正本步骤相关输出文件。
2. 更新 `需要人工核查.md`，记录用户修改点和处理结果。
3. 更新 `下一步交接记录.md`，写明修正后的交接信息。
4. 若修改已经解决当前门禁问题，自动启动 `Handoff` 中声明的下一步 Skill，不再额外等待用户回复“继续下一步”。
5. 若修改后仍存在必须由用户再次确认的关键不确定项，必须重新单独输出 `需要人工核查清单`，等待用户逐项确认后再自动交接。

如果本步骤没有实际人工核查项，也必须单独输出：`需要人工核查清单：本步骤暂无额外人工核查项，请确认是否自动进入下一步。` 用户确认后，必须自动启动 `Handoff` 中声明的下一步 Skill。

## Output Files

```text
15-SCI实验结果图表制作器/
├── 输入/
├── 输出/
├── 过程记录/
├── 质量核查/
├── 需要人工核查.md
└── 下一步交接记录.md
```

核心产物：

- 图件契约记录.md
- SCI图表规划表.md
- 主图与补充图清单.csv
- 图注草稿.md
- 图表数据来源索引.csv
- `质量核查表.csv`
- `需要人工核查.md`
- `下一步交接记录.md`


作图执行协议追加产物：

- `系统环境与权限记录.md`
- `工具调用方式判定表.csv`
- `绘图工具路由表.csv`
- `图表数据来源索引.csv`
- `图表数据模板/`
- `绘图脚本或工具操作指令/`
- `导出图件/`
- `图注与表注草稿.md`
- `图件质量核查表.csv`
- `图表可复现记录.md`

## 图表就绪质量门禁

- 图表就绪数据包是否完整：是否输出或更新 `figure_ready_data_package.csv`、`figure_panel_mapping.csv`、`source_data_traceability.csv` 和 `figure_missing_data_checklist.md`。
- 字段是否可作图：是否包含图号、panel、变量、分组/工况、数值、单位、样本量或案例编号、统计/模型结果、来源文件和脚本/方法。
- 状态门禁是否正确：`candidate`、`demo`、`template`、`missing data` 是否未被写成正式论文结果。
- 图表契约衔接是否明确：是否能交给下一步图表制作器生成或更新 `图件契约记录.md`，并逐 panel 追溯到数据行。

## Human Confirmation Required

- 用户必须确认 Mac/Windows、Computer Use 权限、外部软件操作模式和已安装工具清单。
- 用户确认图表是否来自真实数据
- 用户确认主图/补充图取舍
- AI 不得生成伪造图像、伪造曲线或虚构实验结果


## Quality Gate

- 图件契约是否完整：每张图必须有核心结论、证据链、图件原型、面板地图、数据来源、导出要求、审稿风险和状态标记。
- 图件状态是否合规：`candidate`、`demo`、`template` 或 `missing data` 不得写成正式论文结果。
- 视觉论证是否清楚：主证据、支持证据和稳健性证据应有层级，且每个 panel 提供独特证据。
- 已根据 Mac/Windows 和 Computer Use 权限选择 AI辅助操作、脚本执行或用户手动操作模式。
- Windows 或未授权 Computer Use 时，已输出人工操作步骤、数据模板和核查清单，而不是承诺控制 GUI 软件。
- 已完成图表类型判断、工具路由、绘图执行或人工作图指令输出。
- 每张图均有源数据、工具、参数、导出格式和可复现记录，或已标记为待人工补充。
- 每个图有数据来源、统计方法、图注和质量检查项
- 图表顺序服务于结果主线
- 本步骤产物必须具体、可审核、可追溯，并能支撑下一步继续执行。
- 没有虚构文献、数据、统计、伦理、期刊信息或审稿修改。
- `需要人工核查.md` 已单独列出。
- 下一步交接清楚，且说明未解决风险。

## Experiment Route Quality Parameters

- 材料/工程：制备参数、表征方法、工况、性能指标、重复性、误差线、机理解释。
- 生物/基础实验：细胞/动物来源、样本来源、抗体/试剂批号、独立重复、原始图像、ARRIVE/MIQE。
- 化学/环境/能源：反应条件、检测方法、标准曲线、稳定性、重复性、对照设置。
- 细胞/动物实验：伦理审批、随机化/盲法、样本量、终点、排除标准。
- 图像类结果：原图、处理记录、拼接标记、亮度/对比度调整说明。
- 统计：n 值定义、独立重复/技术重复、正态性、方差齐性、多重比较、效应量。

## Universal Human-AI Boundary

- 用户必须确认真实材料、真实数据、真实实验、真实伦理/授权和真实投稿信息。
- AI 可以整理、检查、提出风险和生成草稿，但不能替用户承诺数据真实、伦理合规、图片无问题、统计无误或期刊录用。
- 缺失材料必须写入 `需要人工核查.md`，不得在正文、摘要、投稿材料或审稿回复中伪装为已完成。
- 动态期刊信息、投稿指南、版面费、分区和影响因子必须联网核验。

## Handoff

Next Skill: `16-SCI实验图像与图表合规核查器`。