Results for “rna-seq”

Framework autônomo de agente de IA biomédica para executar tarefas de pesquisa complexas em genômica, descoberta de fármacos, biologia molecular e análise clínica. Use esta skill ao conduzir pesquisa biomédica em múltiplas etapas, incluindo design de triagem CRISPR, análise de RNA-seq de células únicas, previsão ADMET, interpretação GWAS, diagnóstico de doenças raras ou otimização de protocolos de laboratório. Aproveita o raciocínio de LLM com execução de código e bancos de dados biomédicos integrados.

Access NCBI GEO (Gene Expression Omnibus) for gene expression and functional genomics data — search and download microarray and RNA-seq datasets by GSE, GSM, GPL, or GDS accession and retrieve SOFT, MINiML, and series matrix files. Use when locating public expression datasets, fetching processed expression matrices, downloading a study's supplementary files, or sourcing per-study transcriptomics data for differential-expression analysis. For raw FASTQ sequencing reads by SRA/ENA run accession use alterlab-ena; for reference tissue-expression baselines (median TPM across human tissues) use alterlab-gtex; for cancer cohort somatic mutations and copy-number use alterlab-cbioportal. Part of the AlterLab Academic Skills suite.