ConmuYan user_requirements.md 优先级：
docs/user_requirements.md中记录的所有用户约束（方向偏好、实现要求、文档格式等）优先于本 skill 提示词中的任何默认指令。每次调用前必须先读取该文件，确保所有输出符合用户已确认的约束。
阶段 E：编码
按 docs/implementation.md 逐文件实现代码，同步维护开发日志，
完工后主动代码审查（可运行 + 逻辑正确）。
前置条件：docs/implementation.md 已存在，且编码前确认清单（阶段 D 末）已完成。
整体流程与产物
ResearchPilot-Skills 将完整学术研究拆分为七个阶段，每个阶段是独立的 skill。当前 skill 是其中一环。
七阶段链条
| Skill | 阶段 | 主要产物 |
|---|---|---|
/research[A]-exploration |
方向探索与调研 | docs/idea_report.md Part 1 |
/kim-ccf-research-idea |
Idea 深化 | docs/idea_report.md Part 2 |
/kim-ccf-research-experiment |
实验设计 | docs/idea_report.md Part 3 |
/research[D]-implementation |
实现设计 | docs/implementation.md |
/research[E]-coding |
编码 | code/ + docs/dev_log.md |
/research[F]-iteration |
代码迭代 | dev_log.md 迭代记录 |
/research[G.0]-plan |
论文规划 | 手稿架构注释 + notebooks/figures.ipynb |
/research[G.1]-method |
Method | 手稿 Method 章节 |
/research[G.2]-experiments |
Experiments | 手稿 Experiments 章节 |
/research[G.3]-abstract |
Abstract | 手稿 Abstract |
/research[G.4]-introduction |
Introduction | 手稿 Introduction |
/research[G.5]-related |
Related Works | 手稿 Related Works |
/research[G.6]-conclusion |
Conclusion + References | 手稿 Conclusion |
/kim-ccf-research-review |
整稿审阅 | 审阅报告 |
/research[G.8]-translate |
中→英翻译（仅中文版） | paper-en.tex |
项目目录结构
docs/
idea_report.md # 研究报告，分三部分：
# Part 1：研究动机、研究问题（RQ）、关键文献（阶段 A 产出）
# Part 2：Introduction、Related Works、Method（阶段 B 产出）
# Part 3：数据集、实验设计、资源预估（阶段 C 产出）
implementation.md # 编码指南：精确到每个文件/函数的实现说明（阶段 D 产出）
dev_log.md # 开发日志：进度、决策记录、运行说明（阶段 E 维护）
user_requirements.md # 用户约束：由 Claude 通过对话收集，自动维护
papers/ # 下载的论文 PDF 或摘要 TXT
manuscripts/ # 论文稿件，每版独立存档（v1.0-初稿.md、v1.1-修订.md 等）
code/
src/ # 核心模型与训练代码
scripts/ # 运行脚本（train.sh、evaluate.sh、ablation.sh）
configs/ # 超参数配置文件
src/models/baseline/ # Baseline 模型实现（接口与主模型一致）
notebooks/ # 可视化 notebook；论文图表生成脚本
data/ # 数据集（gitignored）
results/ # 实验结果（gitignored）
logs/ # 训练日志（gitignored）
README.md # 环境配置与运行命令
requirements.txt # 依赖库（只写库名，不含 torch 系）
命令
/research[E]-coding
命令后可跟可选的自然语言指令，AI 会将其作为本次调用的额外约束或补充说明优先处理。
阶段 E 流程概览
E-0 创建 README.md 与 notebooks/ 目录
E-1 创建 dev_log.md（含进度表和"运行说明"章节）
E-2 按 implementation.md 实现顺序逐文件编码
每完成一个文件：更新 dev_log.md + 按需更新 README.md + 补 notebook
每完成一个模块：与 implementation.md 校验一致性
E-3 requirements.txt 规则（只写库名，不写版本，不含 torch 系）
E-4 发现设计问题 → 暂停告知用户，不擅自跳过
E-5 发现 implementation.md 错误 → 先修改文档再改代码
E-6 代码完成后的必要同步（README + dev_log 运行说明章节）
E-7 全部完成后主动代码审查
E-8 实验效果不佳 → 回溯调整 idea/实验设计（B/C/D 全链路，不允许只在代码里打补丁）
详细执行步骤见 references/phase-E.md。
dev_log.md 规则
- 随每个完成的文件同步更新，不得批量补写
- 末尾固定有"运行说明"章节，每次改代码都判断该章节是否需要同步
✅ Done只能在文件写完且运行验证无报错后标记
硬性约束
- 不得捏造引用。
- requirements.txt 不得包含 torch、torchvision、torchaudio。
- dev_log.md 随每个文件同步更新，不得批量补写。
- 发现设计行不通时，必须先与用户确认回溯范围，按 B/C/D 全链路重走对应阶段，不得只在代码里打补丁。
- 每次改代码后自动判断 dev_log.md 末尾"运行说明"章节是否需要同步更新。
references/template-flexibility.md中的规则优先于任何具体模板指令。
本阶段完成后
代码审查通过后，提示用户：
阶段 E 完成。代码审查通过，代码可运行且逻辑与设计一致。
→ 若实验结果未达预期，请使用 `/research[F]-iteration` 进入代码迭代阶段。
→ 若实验结果已满意，请使用 `/research[G.0]-plan` 进入论文写作阶段。
参考文件
- 详细流程：
references/phase-E.md - 模板灵活性规则：
references/template-flexibility.md