HughYau 研究项目的建立、接管与维护
一个 research project 跨越几个月、几十次实验循环、多次 agent 会话。 **Agent 没有跨会话记忆，人也会忘。**没有单一事实源时，每次接手都要重新考古： 当初为什么选这个题？这个实验为什么失败的？下一步本来打算做什么？
这个 skill 建立并维护那个事实源。核心约定只有一条：
PROJECT.md是唯一入口。接手任何项目，先读它；做完任何一轮工作，回写它。
三条不可越过的红线
接管别人的项目时，你面对的是一个你不了解、但对用户很重要的工作区。
- 不删除任何东西。 这个 skill 的工具里根本没有删除操作。
判断没用的东西移进
archive/，附上理由，随时可以移回来。 你对"这个文件没用"的判断有可能是错的，而代价不对称。 - 没得到明确同意前不移动任何文件。 先探查、先汇报、先问。 用户可能正在跑依赖当前路径的脚本。
- 保证可回滚。 动手前先让工作区进入 git 干净状态； 迁移工具默认 dry-run，执行后生成撤销脚本。
工具
SK=<这个 skill 的目录>
# 新建项目
python3 $SK/scripts/init_project.py <path> --name "<一句话主题>" \
[--deadline 2026-11-14] [--venue "CVPR 2027"] [--force]
# 探查一个陌生项目（只读，不改动任何文件）
python3 $SK/scripts/explore_project.py <path> [--json] [--stale-days 60]
# 执行用户已确认的整理方案（默认 dry-run，--apply 才动手；只移动和归档，无删除）
python3 $SK/scripts/migrate.py <path> --plan plan.json [--apply]
# 审计（初始化与否都能跑）
python3 $SK/scripts/project_status.py <path> [--json]
init_project.py 是幂等的——已存在的文件默认跳过并列出来。
--force 会重置模板，但不会直接覆盖：原件先移进 archive/<日期>/ 并记进
archive/MANIFEST.md，再写新模板。
投稿排期归这个 skill 管。 用户给出截稿日期时，直接生成带真实日期的时间表，
不要在对话里复述节奏：--deadline 会按方法论的四周节奏写出
docs/writing/schedule.md（每行具体日期 + 勾选框），之后 project_status.py
持续对照倒计时与章节进度。写作本身怎么做是 paper-writing 的事。
project_status.py 检查什么
它不只是列文件，它执行方法论里的判据：
| 它检查什么 | 为什么这条值得自动检查 |
|---|---|
| 选题落在四种情况的哪一种 | 情况 1/2 = 已有 well-established solution。这时候继续往下做是纯浪费，越早停损越好，所以报 阻塞 而不是警告 |
| PROJECT.md 多久没更新 | >14 天意味着接手者会拿到过期状态，比没有状态更危险 |
| 距截稿天数 vs 章节进度 | 方法论要求截稿前一个月启动写作。倒计时进入 30 天而章节全空 → 阻塞 |
| 实验日志里有多少条没写"本质技术原因" | 这些循环没拿到梯度，下一次改动是随机的。这是项目速度的头号杀手，比实验做得慢更致命 |
| 最近一条实验记录距今多久 | >7 天说明循环频率掉了，要找原因 |
| §6 下一步是否为空 | 没有明确下一个动作的项目会静默停摆 |
走哪条流程
| 情况 | 流程 |
|---|---|
| 全新项目 | 流程 A（下面，一条命令 + 填 §1 §2） |
| 已有的乱项目，用户要整理 | 流程 B：五阶段多轮对话，全文见 references/takeover.md |
| 项目已是这套结构 | Agent 交接协议（下面） |
| 用户想干别的活、项目恰好很乱 | 先把活干了，收尾时提一句可以整理，不要中途自作主张搬文件 |
最后一行是刻意的：整理是一件需要用户投入注意力的事， 挑他没准备好的时候做只会添乱。
流程 A：新建项目
python3 $SK/scripts/init_project.py ~/work/sparse4d \
--name "稀疏视角下的动态场景重建" --deadline 2026-11-14 --venue "CVPR 2027"
然后先只填 PROJECT.md 的 §1 和 §2，配合 research-ideation。
§2 的"四种情况判定"是闸门：判定为情况 1 或 2 就停下来换 failure case，
不要开始写代码。这一步花半天，能省掉半年。判定完跑一次 project_status.py
确认没有阻塞项，再进 §3。
流程 B：接管一个已有的乱项目
用户丢过来的是一个跑了几个月、不是按这套结构建立的文件夹。 这是多轮对话，不是一条命令——五个阶段，每个阶段结束都停下来等用户：
1 探查（只读，一个文件都不动） → explore_project.py
2 汇报画像，问要不要整理 → 先证明你看懂了，再提整理；给 A/B/C 三档
3 拟迁移方案，逐条对齐（多轮） → migrate.py dry-run，用户几乎一定会改几条
4 执行，然后补骨架 → migrate.py --apply，再 init_project.py 补空缺
5 考古式回填 PROJECT.md → 找不到的留空，留空比编造好
开始阶段 1 之前先读 references/takeover.md：
每个阶段的话术、迁移方案的 to 语义、--apply 的安全保证、archive/ 的约定都在那里。
有两处顺序陷阱不看会踩：先迁移再建骨架（反了的话用户真实的 notes.md
就迁不进 docs/topic.md），以及动手前先让 git 进入干净状态。
文件格式
目录结构、PROJECT.md 六节各自何时回写、实验日志一条记录的合格标准
（含一个不合格→合格的改写实例）：references/files.md。
需要建目录、回写 PROJECT.md、或判断一条实验记录合不合格时读它。
其中一条判据值得先知道：实验日志的目的不是记录做了什么，是记录拿到了什么梯度——
只写到"表面原因"就停的记录不合格，project_status.py 会报警。
Agent 交接协议
项目已经是这套结构时：
project_status.py <path>—— 30 秒拿到全局状态和阻塞项- 读
PROJECT.md—— 完整上下文 - 只在需要时按 §6 的下一步深入对应的
docs/或experiments/ - 干完活回写 §4/§5/§6 和"最后更新"日期，再结束会话
不要在没读 PROJECT.md 的情况下就开始改代码或写论文—— 你会重复项目已经排除过的路径，这正是实验日志存在的意义。
**项目不是这套结构时：**走流程 B，从 explore_project.py 开始，
先看懂、再汇报、再问、再动。
与其他 skill 的关系
这个 skill 管状态与结构，具体每一步怎么做在别处：
| PROJECT.md 的节 | 卡住时读哪个 skill |
|---|---|
| §2 选题状态 | research-ideation |
| §3 技术方案 | research-ideation |
| §4 实验状态 | research-experiment |
| §5 论文状态 | paper-writing → paper-revision → paper-self-review |
docs/literature/ |
research-ideation/references/literature-tree.md；检索用 literature-review，读论文用 pdf-explore |
paper/figures/ |
figure-style → figure-composer → paper-narrative |
整体流程图见 research-methodology。