internscience NSFC Ref Alignment
适用场景
- 你有一份 NSFC 标书（LaTeX 项目），希望检查：
.tex里所有\cite{...}/\citep{...}/\citet{...}等引用的 bibkey 是否都存在于.bib.bib条目的基础字段是否完备、格式是否明显错误（如 DOI 非法、年份缺失）- 引用所在句子的“语义主张”是否与该文献（至少从 title/author/year/venue/DOI 等元信息）相匹配，是否存在乱引/过度主张/张冠李戴风险
- 你希望只得到一份报告先人工审核（改
.bib/ 改正文属于大事）。
不适用
- 你希望“自动替换 bibkey / 自动改写正文”——本 skill 默认禁止直接修改（除非你明确要求）。
- 你只是想补齐 BibTeX 条目：优先使用
nsfc-bib-manager。
输入
project_root：标书项目根目录（如projects/NSFC_General）- 可选：
main_tex：主入口 tex（默认main.tex） - 可选：
report_dir：报告输出目录（默认./references，相对你运行 skill 的当前目录） - 可选：
verify_online：是否进行在线核验（默认 false；仅做确定性查询，失败降级）
输出（只读 + 可复现）
中间产物（强制）
所有中间文件必须托管在：
{project_root}/.nsfc-ref-alignment/run_{YYYYMMDDHHMMSS}/
其中 run_{YYYYMMDDHHMMSS} 为时间戳；如同秒重复运行，脚本会追加 -2/-3/...，确保多次分析不冲突。
该目录至少包含：
ai_ref_alignment_input.json：结构化输入（引用位置 + 句子上下文 + 文献元信息 + 校验结果），供宿主 AI 做语义判断ref_integrity_report.md：确定性报告（缺失 bibkey、重复条目、字段缺失、DOI 格式问题等）citations.csv：逐条引用清单（file/line/bibkey/sentence）bib_inventory.json：BibTeX 清单（被引用条目与问题标注）
最终交付（默认）
仅输出一份供用户审核的报告（默认写入 ./references/；用户可指定其他目录）：
NSFC-REF-ALIGNMENT-vYYYYMMDDHHMMSS.md（如同秒重复运行，脚本会追加-2/-3/...避免覆盖）
该报告必须是“只读审查报告”，不得直接修改标书正文或 .bib。
工作流（推荐）
步骤 1：预检与定位
- 确认
project_root存在且包含main_tex。 - 自动解析
main_tex的\input{}/\include{}依赖树，收集所有涉及的.tex文件。 - 自动发现
\bibliography{...}/\addbibresource{...}指向的.bib文件；若发现 0 个.bib，则回退为在project_root下搜索*.bib并给出 warning。
步骤 2：确定性抽取（脚本执行）
运行脚本生成结构化输入与确定性报告：
cd /path/to/ChineseResearchLaTeX
python3 skills/nsfc-ref-alignment/scripts/run_ref_alignment.py \
--project-root "projects/NSFC_General" \
--main-tex "main.tex" \
--report-dir "references" \
--prepare
如需在线核验（建议只对最终稿/重点条目开启）：
python3 skills/nsfc-ref-alignment/scripts/run_ref_alignment.py \
--project-root "projects/NSFC_General" \
--main-tex "main.tex" \
--report-dir "references" \
--prepare \
--verify-online
步骤 3：宿主 AI 语义核查（本 skill 的核心）
宿主 AI 在读取 {run_dir}/ai_ref_alignment_input.json 后，逐条核查：
真实性/存在性（P0）
- bibkey 缺失：正文引用了不存在的条目
- DOI/URL 明显无效或在线核验失败且元信息严重不一致
语义不匹配风险（P0/P1）
- P0：句子对文献作出了“强断言”，但从元信息看高度不可能（如年份矛盾、领域完全不相关、明显张冠李戴）
- P1：可疑但证据不足（元信息不足、缺少 DOI/缺少 title/作者信息不全）
过度主张/弱支撑（P1）
- 例如“首次/唯一/最优/显著优于”但缺乏足够支撑或疑似需要更强引用
证据优先级（强制）： 在线核验结果（若开启） > BibTeX 的 title/abstract > 仅从句子推断（最低优先级）。
步骤 4：生成最终报告（只读）
在 report_dir 写入最终报告 NSFC-REF-ALIGNMENT-vYYYYMMDDHHMMSS.md，必须包含：
- Summary：总引用数、唯一 bibkey 数、缺失条目数、重复条目数、P0/P1 数
- P0（必须处理）：缺失 bibkey、明显伪造/错误元信息、严重语义错配
- P1（建议处理）：字段不全（缺 DOI/缺 year）、弱支撑/过度主张、需要人工复核
- 附录：逐条引用明细（至少包含 file/line、原句、bib 条目关键字段、风险判断与理由）
修改边界（强制）
- 默认不修改任何标书内容与配置：
- 禁止修改：
**/*.tex、**/*.bib、**/*.cls、**/*.sty
- 禁止修改：
- 允许写入：
{project_root}/.nsfc-ref-alignment/**（中间产物）./references/**（最终报告；可由用户改到别处）
- 若用户明确要求“修复引用/修复 bib”，必须先在报告里给出修改计划与影响面，再执行最小化修改（默认不做）。
与 check-review-alignment 的关系（经验复用）
- 共同点：脚本只做确定性抽取；“语义是否匹配”的判断由宿主 AI 完成；输出可追溯的结构化输入与报告。
- 不同点：本 skill 面向标书项目（多文件
\input{}结构），且默认不做任何自动改写（只输出审查报告）。
验证清单（静态自检）
{project_root}/.nsfc-ref-alignment/run_{timestamp}/存在且包含 4 个核心产物（json/md/csv/json）。- 最终报告写入
report_dir，且没有任何.tex/.bib文件被修改。 - 报告对每个 P0/P1 给出：定位（file/line）+ 原句 + 依据 + 建议动作。