kangwang42 科研证据调研
先选择最小充分模式，再核验来源身份、正文论断和当前项目适用性。搜索结果片段与二手转述只用于发现候选来源。
1. 选择工作模式
Rapid verification
用于单个事实、单篇引文、DOI/PMID、标题或少量依据。执行：
- 按 references/source-routing.md 选择主源；
- 核对题名、作者、年份、期刊、DOI/PMID 及更正或撤稿关联；
- 需要引用具体结论时打开摘要或全文核对原句语境；
- 输出简短结论、来源标识、核验层级和未核验项。
Rapid 模式不强制预先登记检索方案或建立完整证据汇总表。题名、作者、期刊等信息正确，不等于正文中的具体论断已经核验。
Formal evidence review
用于结局指标、量表、异常值规则、新方法、多个候选方案或跨领域应用。执行完整流程：明确问题 → 预先登记检索方案 → 分层检索 → 核验来源 → 汇总证据 → 判断证据能否直接回答当前问题及能否用于当前人群或场景 → 记录方法选择及依据。
定义不清的分组、终点、纳排或主分析方法先问用户，文献不能替用户决定研究口径。
2. 核验来源身份
读取 references/source-routing.md。可用确定性脚本核验 DOI、PMID 或标题：
python scripts/verify_sources.py "10.xxxx/xxxx"
python scripts/verify_sources.py "12345678" "article title" --pretty
脚本通过 PubMed E-utilities 与 Crossref 核对元数据和更正/撤稿关系，输出 evidence_id、metadata_verified、full_text_status、claim_verified 与 retrieved_at。网络失败或来源冲突保留未核验状态并返回非零退出码；不得用脚本的元数据结果替代全文论断核验。
无法取得全文或无法核对关键结论时标记“未核验”，不得作为正式论断依据。发现 DOI/PMID 冲突、撤稿或来源不明时剔除或降级，并记录原因。
需要为论文、研究报告或专项统计分析选择报告规范时，完整读取 科研报告规范选择。先按研究设计选择基础规范，再叠加实际实施的方法和数据采集规范；不得因变量名称相似而自动采用专项清单，也不得用单一清单覆盖所有研究设计。
3. Formal 检索协议
仅 formal 模式在检索前填写 references/search-protocol.md：
- 数据库、权威网站、检索日期与覆盖时间；
- 逐库检索式、语言、人群、研究类型和全文纳排条件；
- 去重、筛选方法和停止条件。
保留奠基方法论文，同时重点检索近 3–5 年的指南、验证、更新和系统综述。“最新”不等于只取最近文章。
4. 组织证据
按问题组合证据层级：
- 指南、标准与共识用于定义规范和报告要求；
- 系统综述与 Meta 分析用于总体证据与异质性；
- 奠基方法论文用于方法定义、假设和估计目标；
- 目标领域验证研究用于性能、复现性和适用人群；
- 相邻领域研究仅作间接证据，必须降低论断强度。
Formal 模式按 references/evidence-matrix.md 一条来源一行提取。每条来源使用脚本生成或人工确定的稳定 evidence_id；在 DECISIONS.md 的方法决策中引用这些 ID，形成“证据 → 变量/指标/模型选择”的可追溯链。
来源不一致时比较人群、定义、测量、模型、时间窗和偏倚，不按篇数投票。
5. 跨领域可迁移性评估
逐项判断：
- 构念是否相同，而非名称相似；
- 测量尺度、采样过程与数据生成机制是否兼容；
- 方法假设能否在目标数据中检验；
- 能否做内部验证、校准或复现；
- 间接性如何降低论断强度。
关键项无法判断时，只登记为隔离验证候选，不直接并入主流程。文献只能说明合理范围或核查方向，不能单独证明某个观测值应改成多少。
6. 输出与衔接
Rapid 输出：核验对象、来源身份、元数据状态、全文/论断状态、更正或撤稿关系及简短结论。
Formal 输出：检索方案、来源清单、证据汇总表、候选方案比较、证据与当前问题的直接相关程度和适用性、与证据相符的论断强度、建议采用的方案及所引用的 evidence_id。
进入分析时把方法假设和验证要求交给 biostat-principles，再按项目主语言交给 r-biostats 或 python-biostats；进入写作时把已核验引文和证据边界交给 academic-publishing。本 skill 不代跑模型，也不代写论文正文。