Paper Skill

paper-skill

A prompt library for academic research workflows, covering the full lifecycle from literature reading to journal submission.

Optimized for SCI / IEEE / Nature / IJCAI / TRO submissions.

Companion modules — 加载以下模块获得更深度的专项能力：

• citation-integrity.md — AI引用幻觉检测、Trust-Chain溯源、DOI核查
• journal-strategy.md — 期刊优先决策、FINER评分、期刊风格校准
• quality-gates.md — 7维度35分质量门控、R&R可追溯矩阵、Devil's Advocate自审

Quick Reference by Task

0. 论文类型与叙事结构

在起草、润色、制PPT前，先识别论文类型。不同类型对应不同叙事弧（narrative arc）。

论文核心创新识别（起草前必做）

在正式写作前，请告诉我：
1. 这篇论文解决的核心科学问题是什么？
2. 现有方法/知识存在哪些局限（gap）？
3. 我们的核心创新点是什么（一句话概括）？
4. 最关键的实验证据是什么？
5. 投稿目标期刊是什么？

根据以上信息，确定论文类型（discovery/methods/resource/review），制定写作叙事弧，再进行后续写作。

1. 文献阅读与分析

精读单篇文献

请你仔细阅读这篇文章，给出文章的方法、创新点、实验结果、应用场景，以及这项工作是如何实现持续学习的

总结研究领域现状

总结一下当前[领域名称]的研究现状，有视频的给出视频链接，详细具体给出国内和国外的研究现状，都是用的什么技术实现的，有视频的给出视频链接

综述撰写（多篇文献）

仔细阅读上面所有论文，根据论文写综述，引用标注为[论文完整标题]（不是编号），主题关于[主题方向]

研究现状罗列（含图）

给我[研究方向]的国内外研究现状，把最新的论文罗列出来，包括：文章标题、方法简述、与本工作区别、发表期刊/会议、发表时间、期刊级别，并呈现关键图

深度阅读（提取论证链）

详细阅读这篇论文，提取：
1. 主要科学主张是什么？
2. 可见的证据基础是什么（图表、数据）？
3. 声称的重要性（为什么读者应该关心）？
4. 明显的局限性是什么？
5. 与本领域现有工作的关系？

2. 论文写作与生成

从材料生成完整论文

这两个材料都是我的论文，其中[文件名]是最新且最正确的材料，另外一个包含图片，请结合两个材料生成我的最新论文，你是[期刊]编委，数学公式请生成可编辑的LaTeX版本，生成最终的论文word格式

修改核心创新点表达（非并列结构）

我论文最核心的创新是[核心描述]，其它的作为辅助。你现在写法像并列结构，需要修改这种结构，让核心创新点突出，按照我说的来写，生成修改后的完整中文论文word文档

重写方法部分（SCI一区，中文）

重写方法部分，方法部分逻辑混乱，我要投稿SCI一区，请帮我重写方法部分，中文生成

重写实验部分（SCI一区，中文）

重写实验部分，现在实验部分全部都有问题，我要投的是SCI一区的期刊，中文生成，不要编造我的文章里没有的数据

根据PDF材料填写调查报告

根据我的[PDF文件名]，把[相关内容/大模型相关内容]填写到[调查报告/表格]里面

从上传论文中选取参考文献

根据我的课题技术方案，从我上传的论文里面选取几篇最能参考的论文，列出标题和论文简要内容

生成引言（含参考文献）

生成完整的引言，以及引言所包含的所有参考文献（标题，发表时间，所属期刊或会议）

生成相关工作（含参考文献）

生成完整的相关工作，相关工作部分需要引用5篇[目标期刊]的[年份范围]的研究，其它研究需要最新的一区二区和顶会，给出所有引用参考文献（标题、发表时间、期刊/会议）

引言/相关工作写法规范

引言和相关工作要改成：谁提出了什么方法，做了什么工作，有什么局限性，我们针对这些局限性做了什么。一定要客观，禁止批评别人的方法，禁止踩一贬一

SCI一区论文写作指导（从数据/毕设起步）

这个是我的[毕业论文/实验数据]，请你仔细阅读所有材料，我现在要在现有资料基础上写一篇SCI一区论文，给我一个详细完整的论文写作指导和全文框架，以及生成一篇论文，所有内容生成完整word在桌面上

检查证据与主张的对应关系

你是[期刊]审稿人，检查这篇论文中：
1. 每个核心主张是否有对应的实验证据支撑？
2. 是否存在主张大于证据的情况（over-claim）？
3. 图表与正文描述是否一致？
4. 哪些局限性被忽略或低估了？
请逐点列出，并给出具体修改建议。

3. 论文润色与修改

全文语法/标点错误检查

检查一下这个论文里有没有明显的错误，语法，标点符号，表达等，这个将要发表，帮我检查有没有错误

段落学术化改写

从学术论文的角度修改这段话

顶刊标准全文纠错

你是顶刊期刊编委和审稿人和学术专家，技术大牛，帮我纠正我的论文错误，全文纠正，包括方法，实验，引言，摘要，结论

IJCAI审稿人视角修改（含overleaf对照）

你是IJCAI顶会审稿人，并且还是主编，告诉我这篇文章在逻辑、语句、原理方法、实验结果上是否存在致命的会导致拒稿的问题？请一一罗列并告诉我如何修改，给出具体替换语句，生成中英对照版和overleaf格式版本，详细标注修改的地方

论文精简（保留原意，含overleaf）

精简一点（保留原意和原overleaf格式），去掉冗余部分重新生成中英对照版本，不要丢失参考文献。需要详细告诉我原来是什么，如何修改，在哪里修改

按TRO风格润色（方法/实验/相关工作）

这个是论文[部分名称]，帮我按照SCI一区、TRO的学术语言风格进行润色，要求逻辑缜密，如果原理不对的话请修改出来，生成修改后的完整[部分名称]

IEEE TRO冗余精简（含latex修订）

你是IEEE TRO审稿人和编委，文章现在太啰嗦冗余了，保留核心简要的，删去冗余，告诉我具体修改哪里，用什么句子替换，不要省略，生成完整修改说明中文word

公式符号规范检查

根据我论文的方法部分，帮我看一下图里面的公式字母表述对不对，图里面有公式字母没有对应上论文方法部分的描述，详细告诉我如何修改。要求：变量斜体，函数/常量正体，字母下标不要用英文单词，变量简洁，生成完整修改意见word，公式需要latex格式

实验数据更新（含标红对比）

[描述新增实验数据变化]，帮我更新论文里所有表格数据，包括论文部分所有涉及到这个的描述，生成完整版论文，你修改的地方标红，防止乱码，我是wps打开的，生成完整中文版word

公式全部转为 LaTeX 格式

帮我把论文里面的公式全部改成latex格式的，现在全是一些字符，不是公式，你参考我上传的pdf的公式样式修改，其他地方不要修改，生成修改后的完整论文word文件

论文冗余精简（含修改报告，TRO标准）

这个是我的论文初稿，准备投稿TRO的，但是写的太冗余了，把里面的废话删除，你是编委，帮我修改润色，需要达到TRO标准，逻辑缜密，生成修改报告，详细具体到哪个地方需要怎么修改

论文修改（纯中文输出）

这个是我的论文初稿，写的太冗余了，帮我修改，生成修改后的中文版，讲清楚具体是如何修改的（修改哪里，怎么修改），生成修改的word，全中文版，不要出现英文

LaTeX 排版修复（浮动体/图表位置问题）

我的LaTeX论文存在排版问题：[描述问题：页面稀疏/图表不填满页面/跨页/Float too large/标题孤立/多面板图表排列混乱]

你是Nature主编，帮我诊断并修复LaTeX排版，要求：
1. 先描述具体问题是什么
2. 给出修改哪一行/哪个位置
3. 给出可以直接替换的latex代码
4. 解释为什么这样修改
修改前和修改后的对比都要给出来，生成完整word修订报告

段落失败模式诊断（写作质量审计）

你是Nature审稿人，对这段/这部分文字进行失败模式诊断：
1. 主张→证据→意义的逻辑链是否完整？
2. 是否存在冗余重复或逻辑跳跃？
3. 句子结构是否符合Nature学术风格？
4. 如果无法在不添加内容的情况下修复结构问题，请标记而非覆盖
给出修改建议和替换语句

4. 论文审稿与投稿

论文总结与优缺点

总结全文，你是审稿人，给出论文总结、优缺点，以及明显的问题

指定期刊投稿意见

我要投稿的期刊是[期刊名]，给我关于论文的修改意见以及绘图意见，详细准确，分析我的论文结构有没有需要改进的地方

Nature Communication 写作

这是我的研究内容，我计划投稿nature communication，给出投稿建议，给出论文标题，你是nature审稿人，根据我的研究内容帮我直接写一篇完整的nature communication

IEEE TRO 找拒稿漏洞（含修改清单）

你是IEEE TRO审稿人，帮我找到会导致拒稿的致命漏洞，包括逻辑，理论，实验，以及全文，在不补实验的基础上，给我一个修改清单，包括修改哪里，如何修改，用什么描述语言替换，生成完整word

IEEE TRO 审稿意见（中文，含latex）

你是IEEE TRO审稿人和编委，给出审稿意见和最终结果，检查致命问题，在不补实验基础上给详细修改说明。给我中文版修改意见，修订直接在latex上修改，给我可以复制进去替换的latex代码，精确告诉我修改哪一行，修改前后对比都要给出来，解释为什么这样修改，生成完整word。
要求：LaTeX代码块精确可搜索；排版清晰，修改前/后严格对齐

IEEE TII 审稿人视角（全文审阅）

你是IEEE TII顶刊SCI一区审稿人，并且还是主编，告诉我这篇文章是否存在致命的会导致拒稿的问题，请一一在原文中标注出来，详细告诉我如何修改，给出具体修改替换语句，生成标注后的pdf在桌面上

IJCAI 发表前全文校对（含latex）

帮我对这篇即将发表的文章进行全文检查，检查是否有图片字体错误、单词拼写错误、参考文献错误、表格错误或其他明显错误，帮我进行校对勘误，生成详细具体修订word，修订直接在latex上修改，给我可以复制进去替换的latex代码，生成word在桌面上
修订报告格式参考：[参考word路径]

小修后对照检查（TII）

你是IEEE TII审稿人，检查这篇论文是否按照小修意见进行了修改，检查图片字体、单词拼写、参考文献、表格是否有明显错误，帮我校对勘误，生成详细具体修订word

预审稿报告（Nature 审稿人风格，3份+综合）

你是Nature审稿人，对这篇论文给出预审稿评估。请返回：

Reviewer 1、Reviewer 2、Reviewer 3（三位审稿人仅在侧重点上有所不同，不要编造审稿人身份）：
- 总体评估
- 哪类读者会对结果感兴趣，以及为什么
- 主要优点
- 主要问题
- 必须解决才能建立论文论证的技术缺陷
- 针对Nature标准的评估（originality、scientific importance、technical soundness、readability）
- 录用建议

Cross-review synthesis：
- 三位审稿人的共识优点
- 共识技术风险
- 各审稿人侧重差异
- 最重要的待解决问题

注意：只基于提供的论文内容评估，不编造图表细节、引用或论文中不存在的内容

Science Robotics 投稿（含实验补充建议）

这个是我的论文及附件材料，我要投稿Science Robotics，请给出修改建议，以及实验补充建议，详细到如何做补充实验，以及视频拍摄剪辑，你是Science Robotics的期刊编委，我要保证这篇文章在Science Robotics的录用率在90%，直接帮我修改，包括实验表格，需要绘制什么图，生成最终的修改论文word，中文版本

竞赛评委意见（国创大赛）

你是国创大赛的国赛评委，请给出评审意见，最终能获得几等奖，然后给出详细完整的修改意见，针对每页的修改建议。我需要拿国家级一等奖，生成详细的word

5. 审稿意见逐点回复

确定修改策略（triage优先）

这是期刊的审稿意见，请先帮我分类每条意见：
- 必须做实验响应的（Major concern）
- 可以通过解释/澄清解决的（Minor / Clarification）
- 审稿人的主观意见，可以礼貌不同意的

然后给出回复策略总结：哪里需要补实验，哪里只需要解释，哪里可以措辞分歧。
不要编造实验结果或凭空添加数据。

起草逐点回复信（point-by-point）

你是顶刊论文作者，请帮我起草逐点回复信。

要求：
1. 对每条审稿意见（R1.1, R2.1等）逐一回复
2. 格式：审稿人原文 → 作者回复 → 论文对应修改位置（或标注AUTHOR_INPUT_NEEDED）
3. 语气：尊重但坚定，措辞学术化
4. 不编造实验结果；如需作者补充信息，明确标注[作者需提供：XXX]
5. 生成完整word，包含所有回复和修改位置映射

大修回复（含修改位置映射）

这是大修审稿意见，请帮我：
1. 提取并编号所有编辑意见（E.1等）和审稿人意见（R1.1, R2.1等）
2. 对每条意见起草回复，说明：我们如何响应 + 在论文哪个位置做了什么修改
3. 凡是需要我来补充决定或数据的地方，标注[作者需提供：XXX]
4. 生成最终的回复信word，附修改跟踪表

注意：我是[中文/英文]作者，请对应输出语言

难以响应的意见处理

审稿人提出的这条意见很难响应：[意见内容]

请帮我分析：
1. 这是技术缺陷还是主观偏好？
2. 是否必须做实验？还是可以通过澄清+补充讨论解决？
3. 如果在不补实验的情况下，最佳的回复措辞是什么？
4. 有没有论文中已有的证据可以用来支持我们的立场？

给出具体的回复语句建议

审稿回复QA检查

这是我起草的审稿回复信，请检查：
1. 每条审稿意见是否都有回复（有没有遗漏）？
2. 每个声称的修改是否都映射到了具体的论文位置？
3. 语气是否尊重且学术化？
4. 是否有编造数据或声称了不存在的修改？
5. 是否有需要作者决定但还未填入的placeholder？
生成修订后的完整回复信word

TII审稿人对返修回复进行评审（生成4个文件）

你是TII审稿人及编委，我上传了我的论文和审稿返修意见回复的文档，作为编委和审稿人，请你对我的回复进行评审以及意见修改，详细修改，生成整个评审意见和修改报告，以及直接在我的原文（论文和审稿回复word）中批注出来，生成批注后的两个文件以及评审意见和修改报告4个文件，全是word格式

6. 论文翻译

全文中译英（学术化，Nature标准）

把论文全文翻译为英文，不要丢失参考文献标号和公式，你是nature主编，需要百分百确保翻译后的英文意思和我原来的中文一模一样，不要改变我的意思，需要非常准确及学术化，生成完整word在桌面

部分章节中译英

把论文的[摘要/引言/相关工作/公式部分]翻译为英文，不要丢失参考文献标号和公式，并为公式编号，生成完整word在桌面，[其它部分]保持原来的中文不变

翻译准确性校对（标蓝标红）

对比一下翻译的是否准确，不准确的地方请帮我修改，修改前标蓝，修改后标红，并中文说明修改原因，生成修改后的完整word在桌面上

实验部分翻译校对

对比一下实验部分的翻译是否准确，不准确的地方请帮我修改，修改前标蓝，修改后标红，中文说明修改原因，生成修改后的完整word和详细修改说明报告（只标红要修改的句子，不要大段大段标红），只对比实验部分

审稿意见英译中

把这个审稿意见翻译为中文版本的word在[目标路径]下，帮我排版好，以及给我如何修改论文的建议

7. 参考文献管理

参考文献顺序编排

帮我把文中的参考文献编号按照顺序编排，检查文章中提到的这些参考文献是否与文章描述内容相符，不相符或有较大差异的请在文中标注出来，其它的不要改动，生成修改后的完整word在桌面上

参考文献与引用内容匹配检查

帮我详细检查全文的参考文献以及对应引用内容对不对，引用的文献及其对应的内容是否匹配，生成详细修改word，在文章中直接修改，修改的地方标红，原来的地方标蓝，形成对比

核实引用文献真实性

确认一下这里面的参考文献是否正确，是否真的有这些参考文献，每个参考文献引用的内容是否正确，仔细查看阅读每个参考文献，如果错误请纠正指出

检查重复/错误参考文献

帮我检查有没有重复的和错误的参考文献，如果有请帮我修改，你是SCI一区编委，检查文章中是否有逻辑错误、语病或需要修改润色的地方，有的话标红并指正，生成修改后的完整word

添加引用句（相关工作）

在相关工作对应的地方添加一句话，把[传统方法/经典文献]与本方法的区别与联系加进去，以提升论文学术深度。告诉我在具体哪个位置添加，添加什么内容

8. 代码相关

报错修复（含调试验证）

上面是我的代码，报错为：[错误信息]。解决报错，修改后你自己调试10遍，确保可运行且没有报错，然后生成完整代码给我

定向修改代码（告诉我改哪里）

这个函数，你告诉我修改哪里，怎么修改

视频逐帧导出

把这个视频帮我导出为一帧一帧的图片，按每s一帧进行导出，导出到[目标路径]这个文件夹下面

Isaac Sim 关节控制（cmd命令行）

仔细阅读这个链接，我要如何在isaac sim中控制机器人usd的各个关节（cmd命令行控制）：https://docs.isaacsim.omniverse.nvidia.com/4.5.0

宇树强化学习地形相关代码排查

这个是宇树的开源项目 https://github.com/unitreerobotics/unitree_rl_gym ，我修改了地形后在训练的时候还是平地，你帮我看看这个代码里涉及地形的还有哪几个代码？

LeRobot 数据采集方法（详细）

仔细阅读这个项目，详细具体告诉我如何采集数据：https://github.com/huggingface/lerobot

强化学习抓取优化（含课程/奖励/归一化）

我要实现强化学习稳定抓取，帮我优化，提出改进意见，包括观测标准化（RunningNorm）、奖励简化与可视化、课程前进/回退（hysteresis）等方面

硬件原理图问题解决

pdf是我的硬件原理图，根据这个原理图帮我解决项目日志word里的问题，详细面对每个问题提出最靠谱的解决方案

9. 绘图与可视化提示词

图表合同（绘图前必做）

在绘制图表前，先回答以下问题：
1. 这个图表要证明的核心结论是什么（一句话）？
2. 数据如何支持这个结论（证据逻辑）？
3. 最适合的图表类型是什么（线图/柱图/热图/散点图）？
4. Hero panel是哪一个（最能展示核心结论的子图）？
5. 投稿期刊是什么？需要什么分辨率和格式（PNG@300dpi/PDF/TIFF）？
6. 调色板约束（最多3-4种颜色，黑白可读）？

确认以上信息后再开始绘图。

方法流程图提示词（nano banana）

这些是我的代码，我要投稿SCI一区，根据我的方法生成详细的AI提示词，用于nano banana绘图（方法流程图），只要一个完整的详细的提示词，不要生成无关内容，学术美观，nature级别。按照AI顶会标准，提示词需要非常详细，包括配色、用什么元素、多加图标和元素图

实验结果图提示词（nano banana）

这个是我的论文，我上传的是我的实验结果图，我的[实验名]是验证[实验目的]，生成实验结果图的排版重制AI提示词，用于nano banana绘图（实验结果图），只要一个完整的详细的提示词，学术美观，nature级别

对比图提示词（基于表格）

我打算把[表1、表2、表3]画成对比图，有什么好看直观学术化的图能表示的？生成AI提示词，用于提示[目标AI工具]进行结果分析图绘制，不要生成无关内容，我只要提示词

实验数据可视化（从表格到图）

我实验部分，哪些表格里的结果可以画成数据结果分析对比图？都帮我画成对比图，生成修改后的论文全文word在桌面上，图片放在桌面新建的文件夹里

图注与题名生成

对这张图生成标题和图注以及针对论文正文的引用

表格 Nature 风格优化

这个表格帮我进行优化，按照nature的优化美化风格，其它的不要改动，生成修改后的完整word在桌面上

概念元素图提示词（智能体/产品）

结合我的产品手册，智能体，就是一个[设备描述]的元素图，给我用于nano banana绘图的AI提示词就行，生成.txt文件在桌面上，元素图是中文的

图表质量审计（出版前）

你是Nature图表编辑，审查这张图的出版质量：
1. 分辨率是否足够（≥300 DPI for raster）？
2. 字体大小是否在投影/印刷时可读（≥8pt）？
3. 颜色是否对色盲友好？黑白打印时是否可区分？
4. 误差棒/显著性标记/n值是否完整？
5. 图注是否完整（包含所有panel说明、统计方法、样本量）？
6. 子图标签（A、B、C）是否清晰一致？
给出具体修改建议。

BioRender风格结构图重绘（SVG）

帮我把这个结构图补充详细了重新绘制一张，按照第二张图片，在第一张图的基础上修改，要求biorender风格，SVG格式

10. PPT 制作与答辩

从论文生成转博答辩PPT（论文类型驱动）

这些是我的研究材料，根据以上材料完善和修改我的转博答辩PPT。

首先识别我的研究类型（discovery/methods/resource），确定叙事弧，然后：
- 要求具备博士深入提出科学问题、聚焦科学问题并解决科学问题的学术能力
- 每个slide必须推进论证，不是简单罗列
- 所有slide内容和演讲稿用中文
- 生成修改后的完整PPT，不要生成无关内容

修改PPT某一页

这个PPT的[某一页]的内容要修改一下，[修改内容描述]，生成修改后完整的一页PPT给我

从PPT生成演讲稿+评委问题

这是我的答辩PPT，请根据我的PPT生成完整的演讲稿，及5位评委可能会问的问题及其详细解答，生成完整word

论文PPT化（含研究现状对比）

[描述修改内容和方向]，重新生成完整PPT。加上当前研究现状：有没有人用了同样的方法，把文章标题、方法简要描述、与本工作的区别、发表期刊/会议、发表时间、期刊级别一起列进去

PPT Slide质量检查

检查这个PPT的质量：
1. 是否有broken figure references或missing images？
2. 是否有text overflow（slide上文字过多）？
3. 每个slide是否只传递一个核心信息？
4. 论证flow是否清晰（背景→问题→方法→结果→意义）？
5. 术语是否在整个deck中一致？
6. 图表质量是否足以投影展示？
给出修改建议，生成修改后的完整PPT

应用案例PPT（机器人化学实验应用）

应用案例加一个精准机器人化学实验师，用我这个设备来做化学实验的，生成PPT

11. 中英文对照阅读

全文中英文并排阅读（含图表定位）

请帮我阅读这篇论文，生成完整的中英文并排Markdown阅读文档：

要求：
1. 每个章节：英文原文 + 中文翻译并排
2. 所有图表和表格在对应文字位置就近呈现（不要只放末尾）
3. 建立术语表（科学术语保留英文，括注中文）
4. 不要降级为摘要或概述——我需要完整的内容
5. 如果图表提取有问题，在注释中说明，但不要省略内容
6. 保留所有参考文献编号

来源：[PDF路径 / DOI / arXiv链接 / 粘贴文本]

论文精读（提取核心论证）

详细精读这篇论文：
1. 科学问题是什么？
2. 作者的核心主张是什么（一句话）？
3. 关键证据是什么（关键图表、数据）？
4. 方法的核心创新点是什么？
5. 实验验证了什么，有什么局限？
6. 这个工作对[我的研究方向]有什么参考价值？

用中文输出，重要术语保留英文

快速论文摘要（组会/汇报用）

请快速总结这篇论文，用于组会汇报：
- 一句话：这篇文章做了什么
- 背景与动机（2-3点）
- 方法核心创新（2-3点）
- 最重要的实验结果（1-2个关键数字或图）
- 局限性与未来方向
- 与我研究的相关性

控制在500字以内，中文输出

术语对照表生成

阅读这篇论文，生成论文中所有专业术语的中英对照表：
- 模型/方法名称
- 数据集名称
- 指标名称
- 领域专有名词
- 缩写展开

格式：英文术语 | 中文译法 | 首次出现位置

12. 数据可用性声明（FAIR合规）

起草数据可用性声明

请帮我起草这篇论文的数据可用性声明（Data Availability Statement）。

我的数据情况：
- 新生成的数据：[描述数据类型和存放位置/计划存放位置]
- 重复使用的公开数据：[数据库名称和accession number]
- 代码/脚本：[GitHub链接或计划]
- 是否有受限数据（临床/隐私）：[是/否，原因]

要求：
1. 符合[Nature/IEEE/目标期刊]的数据共享要求
2. 每个数据集明确映射到具体repository和identifier
3. 不编造DOI或accession number，未确定的用[AUTHOR_INPUT_NEEDED]标注
4. 遵循FAIR原则（可发现、可访问、可互操作、可复用）
5. 生成英文版（如需中文说明也一并提供）

FAIR元数据审计

对这篇论文的数据共享方案进行FAIR审计：

Findable（可发现）：
- 是否使用了持久标识符（DOI/accession number）？
- repository中是否有清晰的元数据和描述？

Accessible（可访问）：
- 是否提供了公开URL或accession number？
- 如果是受限访问，访问流程是否清晰？
- 许可证是否明确说明？

Interoperable（可互操作）：
- 是否使用了标准化格式（FASTQ/CSV/etc）？
- 是否包含文件格式说明和README？

Reusable（可复用）：
- 许可证是否允许再用？
- 数据来源和版本控制是否记录？

列出每个数据集的FAIR合规状态，以及需要改进的地方

repository选择建议

我的论文数据类型是[基因组测序/单细胞/图像/化学/材料/通用/代码]，
目标期刊是[期刊名]，
请推荐合适的数据repository，并说明：
1. 推荐的repository名称和网址
2. 如何获取accession number或DOI
3. 需要准备哪些metadata
4. 数据许可证建议

13. 学术文献检索

多源文献搜索策略

我需要检索关于[研究主题]的文献，请帮我：
1. 构建搜索关键词（Boolean operators + 同义词扩展）
2. 确定应该在哪些数据库检索（PubMed/arXiv/Scopus/Google Scholar，根据学科）
3. 给出具体的搜索语句
4. 说明如何过滤（发表年份：[年份范围]，期刊级别：一区二区/顶会）
5. 如果结果太多，如何进一步精炼

学科领域：[生物医学/计算机/工程/其他]

MeSH检索策略（生物医学）

帮我构建关于[研究主题]的PubMed MeSH搜索策略：
1. 识别核心MeSH主题词和qualifiers
2. 构建完整Boolean查询语句（含Explode和限定符）
3. 给出预期结果量评估
4. 提供用于后续复用的查询字符串

目标：找到[年份范围]内发表在高水平期刊上的相关文献

引用文献真实性核查

请帮我核查以下引用文献是否真实存在且与引用内容匹配：

[粘贴引用列表或文章段落]

检查内容：
1. 作者、标题、年份、期刊是否一致
2. 引用的内容描述是否与原文相符
3. 标注不确定或需要手工确认的条目

对于无法确认的条目，请明确标注[需要手工核实]

相关文献发现（给定一篇种子论文）

给定这篇论文：[标题/DOI/arXiv链接]

请帮我找到：
1. 该论文引用的最重要的5-10篇基础文献
2. 引用该论文的重要后续工作
3. 同期发表的相关工作（parallel work）
4. 与该论文方法最相关的近3年新工作

按照相关性排序，给出标题、作者、期刊、年份、DOI

14. 文件与桌面管理

桌面整理归类

帮我整理桌面路径[路径]，进行归类分类，并生成修改的路径导览，导览生成word格式在桌面上，需要详细具体到每个文件名+后缀

Excel表格整理美化

这个子表也帮我整理一下，覆盖掉原来的子表，颜色太单调了，区分一下，突出重点

研发成本与售价表

根据这个战略合作协议生成研发成本和售卖价格，研发成本可以高，售卖价格按硬件成本加软件费，[产品描述]，生成研发成本和售价表格作为一个word在桌面上

合同/协议分析

我是CTO，帮我分析一下这个协议里对我不合理的地方，帮我标红，并告诉我如何修改，生成完整word给我

试卷详细解答生成

给出这套试卷的详细解答，公式用latex格式，不要生成代码或者符号，生成完整的详细的解答word在桌面上，需要非常详细，能够教人学会，给出非常非常详细的步骤，相当于你是老师

期末作业生成（含图表和参考文献）

期末作业的主题是[主题]，字数要求在1500字以上，帮我生成这个，包含图片和表格，包括真实有效的参考文献，要有图片

15. 去AI化写作检测与修复

AI生成的学术文本有18类可识别模式，投稿前必须清除，否则容易被编辑或审稿人识别为AI写作。

AI写作18类高频模式

全文去AI化扫描（一键检测18类模式）

你是学术写作编辑，对这篇论文/段落进行去AI化检测：

请扫描以下18类AI写作模式并逐一标注：
1. 显著性通胀词（groundbreaking/revolutionary/unprecedented）
2. AI高频词（delve/intricate/nuanced/robust/pivotal/leverage/commendable/multifaceted）
3. 填充过渡词（Furthermore/Moreover/Notably/It is worth noting）
4. 模糊量化（several/numerous/a variety of）
5. 过度规避（may potentially/could possibly/might perhaps）
6. 对称式列举（Firstly...Secondly...Thirdly）
7. 空洞结语（In conclusion/In summary/To summarize）
8. 元评论（This section will discuss/In this paper we present）
9. 反复前指（As mentioned earlier/As discussed above）
10. 领域套话开头（In the realm of/In the field of/With the advent of）
11. 全知免责声明（To the best of our knowledge）滥用
12. 情感性强调（very important/quite significant/rather crucial）
13. 修辞问句
14. 被动语态滥用（It was observed that/It has been shown that）
15. 平行结构堆砌
16. 假精确（无来源的近似数字）
17. 显而易见陈述（It is clear that/Obviously/Evidently）
18. 句式单一化

输出格式：
- 每条模式：原句 → 修改建议 → 修改后版本
- 标注严重程度（高/中/低）
- 最后给出整体AI痕迹风险评分（0-10）
生成完整检测报告word

指定模式精准清除

对这段文字，精准清除以下AI写作模式：[从上表选择1-3个模式编号]

要求：
1. 找出所有该模式的实例
2. 给出每处的修改建议和替换句
3. 不改变原文的科学意思和数据
4. 修改前标蓝，修改后标红
5. 生成修改后的完整段落

语言自然度提升（使人类化）

这段文字AI痕迹明显，请在不改变科学内容的前提下使其更自然：

要求：
1. 删除所有填充过渡词和套话开头
2. 将平行列举改为有层次的论证结构
3. 被动句改主动，明确施动者（作者/数据/模型）
4. 删除情感性副词，改用数据/证据支撑
5. 混合句式长度（20-30词的长句 + 10词内的短句）
6. 保留所有专业术语、数据、引用标号不变

生成修改后的段落，并标注每处改动原因

摘要去AI化（高风险区域）

论文摘要是AI检测重点区域，对这个摘要进行去AI化重写：

禁止使用：groundbreaking, revolutionary, unprecedented, delve, intricate, robust, pivotal, leverage, Furthermore, Moreover, It is worth noting, In conclusion, In this paper we propose, To the best of our knowledge（只允许出现一次）

要求：
1. 第一句直接给出研究问题或核心发现，不要从背景开始
2. 方法：具体描述做了什么，不用"we propose a novel framework"
3. 结果：给出关键数字和对比基线
4. 意义：一句话，具体到哪类读者/应用会受益
5. 控制在250词以内
生成修改后的摘要

投稿前AI痕迹快速自查清单

投稿前30秒自查，对这篇论文快速检查：
1. 摘要第一句是否以"In recent years"或"With the rapid development of"开头？（如是，改掉）
2. 全文是否有"delve into"？（删去）
3. 引言是否有3个以上"Furthermore/Moreover/Additionally"段首？（精简）
4. 结论是否以"In conclusion/In summary"开头？（删去，直接陈述）
5. 全文是否有"It is worth noting that"？（删去）
6. 是否有连续3句以上"It was found that/It was observed that"？（改主动）
7. 是否有"groundbreaking/revolutionary/unprecedented"？（删去）

逐条检查并给出修改，生成快速修改报告

16. IMRAD结构与报告规范

IMRAD是实验性研究论文的标准结构（Introduction, Methods, Results, And Discussion）。临床/观察性研究额外需要遵循报告规范（CONSORT/PRISMA/STROBE等）。

主要报告规范速查

IMRAD结构写作指导

根据IMRAD结构，对这篇[实验性/方法类]论文进行结构诊断：

Introduction（引言）应包含：
- 研究背景与知识gap（漏斗式从宽到窄）
- 现有方法的局限性（逐条列出）
- 本文目的和核心贡献（明确的1-2句）

Methods（方法）应包含：
- 研究设计/实验设置（完整可重复）
- 数据来源和预处理
- 模型/算法描述（含超参数）
- 评价指标定义

Results（结果）应包含：
- 主要结果（先陈述，后数据）
- 对比基线和消融实验
- 图表所有panel的文字描述

Discussion（讨论）应包含：
- 主要发现的解释（与假设对比）
- 与现有文献的关联
- 局限性（诚实列举）
- 未来方向

请对照以上标准逐节检查，给出具体缺失和改进建议

CONSORT 2025 合规检查（RCT）

你是CONSORT 2025专家，对这篇随机对照试验（RCT）论文进行合规检查：

必须核查的25条目（重点检查以下高风险项）：
1a. 标题是否包含"randomised"关键词？
4a. 合格标准（纳入/排除）是否明确定义？
6a. 主要/次要结局指标是否在方法中预先说明？
7a. 样本量如何计算（含依据和参数）？
8a. 随机序列如何生成（方法和类型）？
9. 分配隐藏机制是否描述？（非随机化本身，而是隐藏机制）
10. 谁执行随机化？
11a. 是否说明盲法（参与者/执行者/评估者）？如无盲法，理由？
13a. 是否附CONSORT流程图（筛查→随机→分析人数）？
16. 每组分析人数（分母）是否与随机化人数一致？
17a. 主要结局是否报告效应量+95% CI？
22. 是否登记（临床试验注册号和注册时间）？

逐条标注：✅ 合规 / ⚠️ 部分合规（具体说明） / ❌ 缺失（补充建议）
生成CONSORT合规报告word

PRISMA 2020 合规检查（系统综述/Meta分析）

你是PRISMA 2020专家，对这篇系统综述/Meta分析进行合规检查：

重点核查条目：
3. 是否提供完整检索策略（至少一个数据库的全文）？
6. 是否说明排重方法？
7. 是否描述文献筛选流程（初筛/全文审阅人数及分歧处理）？
8. 是否有PRISMA 2020流程图（4层：识别→筛查→合格→纳入）？
9. 是否记录排除原因（全文排除阶段）？
13a. 主要Meta分析是否报告各研究效应量+95%CI+异质性I²？
13b. 是否附森林图（Forest plot）？
15. 是否进行偏倚风险评估（说明使用的工具）？
16. 是否进行发表偏倚评估（漏斗图或Egger检验）？
17. 是否进行敏感性分析？
21. 是否注册（PROSPERO或类似平台，注明注册号）？

逐条标注：✅ / ⚠️ / ❌，并给出缺失内容的补充模板
生成PRISMA合规报告word

STROBE 合规检查（观察性研究）

你是STROBE专家，对这篇[队列研究/病例对照研究/横断面研究]进行合规检查：

重点核查条目：
1. 标题或摘要是否标明研究设计类型？
4. 研究设置（地点、时间、背景）是否清晰？
6. 暴露变量（队列/横断面）或病例/对照定义（病例对照）是否明确？
7. 结局指标和暴露的测量方法是否描述？
9. 偏倚来源（选择偏倚、信息偏倚、混杂）是否讨论？
12a. 连续变量是否报告均数±SD或中位数(IQR)？
12b. 是否报告缺失数据的处理方法？
12e. 队列研究：失访原因和人数是否报告？
16. 混杂因素调整策略（多变量模型变量选择依据）是否说明？

逐条标注：✅ / ⚠️ / ❌，给出补充建议
生成STROBE合规报告word

ARRIVE 2.0 合规检查（动物实验）

你是ARRIVE 2.0专家，对这篇动物实验论文进行合规检查：

必要条目（Essential 10）重点核查：
1. 是否说明动物实验伦理批准（机构+批准号）？
2. 研究设计是否随机化（如何分组，是否盲法）？
3. 样本量如何确定（幂分析或文献依据）？
4. 是否报告排除动物数量和原因？
5. 所有结局指标是否在引言/方法中预先说明？
6. 统计方法是否完整（含使用的软件和版本）？
7. 实验动物的所有特征是否描述（品系/性别/年龄/体重/健康状态）？
8. 实验环境（饲养条件、光照周期）是否报告？
9. 每组实际分析动物数是否明确（分母一致性）？
10. 是否提供每只动物的原始数据或汇总统计（均数±SEM/SD）？

逐条标注：✅ / ⚠️ / ❌，给出缺失内容的补充建议
生成ARRIVE合规报告word

一键识别适用报告规范

根据这篇论文的研究设计，帮我确定应该使用哪个报告规范：

请分析：
1. 研究类型是什么（RCT/观察性/Meta分析/动物实验/病例报告/方法类）？
2. 适用的报告规范是什么（CONSORT/STROBE/PRISMA/ARRIVE/CARE/IMRAD）？
3. 目标期刊[期刊名]是否强制要求提交规范对照表？
4. 需要额外附上哪些材料（CONSORT流程图/PRISMA流程图/注册号）？

给出明确的规范选择建议和投稿时需要准备的checklist材料清单

方法部分可重复性审查

你是实验可重复性审查员，对这篇论文的方法部分进行审查：

检查以下可重复性要素：
1. 所有试剂/材料是否有厂商、货号、批号？
2. 所有仪器是否有型号、参数设置？
3. 所有软件是否有版本号和参数？
4. 统计方法：使用的检验名称、显著性阈值（α）、多重比较校正方法？
5. 样本量：每组n是多少？如有排除，理由和数量？
6. 时间点/剂量：是否精确描述？
7. 代码/数据：是否提供可访问的链接或accession number？

逐条标注，给出具体补充内容，生成可重复性审查报告word

17. 期刊优先策略

在写论文之前，先确定目标期刊。期刊决定了你的写作深度、图表标准、字数限制和论证框架。"先写后选刊"会导致大量返工。

详细提示词见伴侣模块：journal-strategy.md

快速期刊选择（写作前）

我有一篇[方法类/应用类/综述类/临床类]论文，核心亮点是：
[一句话描述]

请推荐3个最匹配的目标期刊：
- 最高目标（冲刺）：[期刊名 + IF + 为何适合]
- 主要目标（最匹配）：[期刊名 + IF + 为何适合]
- 保底选择（高录用率）：[期刊名 + IF + 为何适合]

对主要目标期刊，给出：写这篇论文需要特别注意哪些格式和内容要求？

FINER研究问题快速评分

请对我的研究问题进行FINER快速评分（各5分，满分25）：

研究问题：[明确描述，1-2句话]

F — Feasible（可行性）：[1-5分] [理由]
I — Interesting（重要性）：[1-5分] [理由]
N — Novel（新颖性）：[1-5分] [理由]
E — Ethical（伦理性）：[1-5分] [理由]
R — Relevant（相关性）：[1-5分] [理由]

总分：[X]/25

≥22：优秀，可直接写作
18-21：良好，建议强化低分维度
<18：建议修改研究问题后再写作

对低分维度给出具体改进建议

期刊风格校准卡

我计划投稿到[目标期刊名]，请基于该期刊的特点，生成"风格校准卡"：

分析该期刊：
1. 摘要结构（几段/几句/典型开头方式）
2. 引言逻辑（漏斗式/问题-解决，gap在第几段）
3. 结果表述（先数据还是先结论）
4. 语言风格（句长/语态/是否第一人称）
5. 引用密度（引言每段平均几条引用）
6. 特殊要求（structured abstract/数据共享/代码开源）

输出：一页风格校准卡，供写作时参考

18. 引用诚信核查

AI辅助写作存在引用幻觉风险（2026年研究发现14.6万条幻觉引用）。投稿前必须核查引用真实性。

详细提示词见伴侣模块：citation-integrity.md

引用幻觉扫描（投稿前必做）

请对我这篇论文的参考文献进行幻觉风险扫描：

重点检查：
1. 期刊名称是否为真实期刊（无异常拼写/杜撰期刊名）？
2. 作者姓名格式是否正常（无随机字符）？
3. 年份与卷期号是否匹配？
4. DOI格式是否合法（10.XXXX/YYYY格式）？
5. 被引内容是否真的支持对应的论点（而非仅主题相关）？

对每条可疑引用标注：
🔴 高风险（可能幻觉）/ 🟡 中风险（需手动核实）/ 🟢 低风险

[粘贴参考文献列表]

Trust-Chain核心论点溯源

请为我论文的核心论点建立Trust-Chain（证据链）：

论点：[你最重要的声明，1-2句话]
支撑引用：[引用信息]

三层核查：
层1 — 引用真实性：该文献是否真实存在？
层2 — 原文匹配：原文是否真的说了这个论点？（请引用原文段落）
层3 — 逻辑一致：我的声明与原文结论是否一致，还是存在过度解读？

结论：✅ 证据链完整 / ⚠️ 需要补强（说明差距）/ ❌ 引用不支持论点（建议替换）

19. 质量门控自评

论文投稿前，用7维度35分框架进行结构化自评。≥28/35 方可提交，<28 需定向改进。

详细提示词和R&R可追溯矩阵见伴侣模块：quality-gates.md

7维度35分快速自评

请对这篇论文进行7维度质量评估（各5分）：

1. 原创性（Originality）：[1-5分] [理由]
2. 论证质量（Argumentation）：[1-5分] [理由]
3. 文献覆盖（Literature Coverage）：[1-5分] [理由]
4. 方法严谨性（Methodological Rigor）：[1-5分] [理由]
5. 语言清晰度（Clarity）：[1-5分] [理由]
6. 学术影响（Academic Impact）：[1-5分] [理由]
7. 技术准确性（Technical Accuracy）：[1-5分] [理由]

总分：[X]/35

≥28 ✅ 可投稿 / 24-27 ⚠️ 需改进 / <24 ❌ 重大修改

对得分≤3的维度给出具体改进建议

R&R修订可追溯矩阵（返修必用）

请生成R&R修订可追溯矩阵，核查我声称的修改是否真实存在：

| 意见编号 | 审稿人意见 | 我声称的修改 | 修改位置 | 真实存在？ | 是否响应意见？|
|---------|----------|------------|---------|----------|------------|
| R1.1 | [意见] | [修改] | [位置] | ✅/❌ | ✅/⚠️/❌ |

[粘贴审稿意见 + 回复信 + 修订稿相关段落]

对❌/⚠️项给出修复方案

20. CRediT作者贡献声明

CRediT（Contributor Roles Taxonomy）是ICMJE和多数顶刊现在要求的标准化作者贡献声明格式，包含14个标准角色。

CRediT声明生成

请根据以下信息，生成符合CRediT规范的作者贡献声明：

作者列表及贡献：
- 作者A（通讯作者）：负责了[具体工作]
- 作者B：负责了[具体工作]
- 作者C：负责了[具体工作]
- 作者D：负责了[具体工作]

CRediT 14个标准角色（每位作者对应哪些）：
1. Conceptualization（概念化/研究思路提出）
2. Data curation（数据整理/管理）
3. Formal analysis（统计/数学分析）
4. Funding acquisition（资金获取）
5. Investigation（实验执行/数据收集）
6. Methodology（研究方法设计）
7. Project administration（项目管理）
8. Resources（资源提供，如仪器/材料/数据）
9. Software（代码开发/编程）
10. Supervision（监督指导）
11. Validation（验证结果可重复性）
12. Visualization（数据可视化/图表制作）
13. Writing – original draft（原稿写作）
14. Writing – review & editing（审阅与修改）

输出格式（Nature/Elsevier标准）：
"[作者A]: Conceptualization, Methodology, Writing – original draft, Supervision. [作者B]: Software, Validation, Visualization. ..."

注意：每位作者至少有1个角色；通讯作者通常有Conceptualization和Supervision

CRediT声明语言润色

请将以下CRediT声明润色为期刊发表标准：

原始声明：
[粘贴你的初始描述]

要求：
1. 使用CRediT标准的14个角色名称（不要自创角色名）
2. 按作者顺序（通讯作者放最后或标注*）
3. 每位作者的角色用逗号分隔，作者间用句号分隔
4. 语言简洁，不添加额外解释

输出标准格式的CRediT声明

21. 伦理声明、利益冲突与预印本

这三类声明在顶刊投稿中越来越重要，缺少会直接导致退稿或重大修改。

伦理声明起草

请帮我起草这篇论文的伦理声明：

研究类型：[人体研究/动物实验/数据研究/纯算法研究]

我的伦理情况：
- 伦理审批机构：[机构名称，如：XX大学医学伦理委员会]
- 审批编号：[编号，如：XXIRBXXXXXX，或"待获取"（标注[AUTHOR_INPUT_NEEDED]）]
- 是否涉及人体受试者：[是/否]
- 是否获得知情同意：[是/否/豁免（说明原因）]
- 是否涉及动物实验：[是/否]
- 数据是否为公开匿名数据（无需伦理审批）：[是/否]

输出：
1. 中文版伦理声明（用于国内期刊）
2. 英文版伦理声明（用于SCI/国际期刊，符合[目标期刊]要求）
3. 若信息不完整，用[AUTHOR_INPUT_NEEDED: xxx]标注缺失项

利益冲突声明（COI）

请帮我起草这篇论文的利益冲突声明（Conflict of Interest Statement）：

情况：[以下选择/描述实际情况]
- 所有作者均无利益冲突
- 资助方：[资金来源，如：国家自然科学基金NSFC No.XXXXXXXX]
- 是否与商业公司有合作：[是/否]
- 是否持有相关专利：[是/否]
- 是否为期刊编委：[是/否]

目标期刊：[期刊名]（不同期刊COI格式略有不同）

输出：符合[目标期刊]要求的利益冲突声明标准格式

资金致谢（Funding/Acknowledgement）

请帮我生成资金支持致谢部分：

资金来源：
- [基金名称 + 批准号 + 资助作者姓名]
- [例：国家自然科学基金 No.62373123（陈X）]
- [例：National Natural Science Foundation of China (NSFC) under Grant 62373123]

其他致谢（可选）：
- 计算资源：[如：感谢XX大学HPC中心]
- 数据来源：[如：感谢XX数据库提供公开数据集]
- 技术支持：[如有]

输出：中英文两版致谢，格式符合[目标期刊]要求

预印本工作流（arXiv/bioRxiv）

我计划在投稿前/同时将论文上传到预印本服务器。请指导：

预印本平台选择：
- arXiv：适合 CS/数学/物理/统计/电气工程 → 分类建议：[cs.XX / eess.XX / stat.XX]
- bioRxiv：适合生命科学/生物医学
- medRxiv：适合临床/公共卫生
- SSRN：适合社会科学/经济/法律

我的论文方向：[领域]

请告诉我：
1. 推荐上传哪个预印本平台？具体分类（category）？
2. 目标期刊[期刊名]是否允许预印本（Sherpa/RoMEO政策）？
3. 上传预印本时需要准备哪些内容（标题/作者/摘要/PDF/关键词）？
4. 预印本上传后，在论文中如何引用自己的预印本？
5. 期刊接收后，是否需要在预印本页面更新发表信息？

给出完整的预印本发布流程

AI辅助声明

越来越多期刊要求作者声明是否使用了AI写作工具（如ChatGPT/Codex/Grammarly等）。

请帮我起草AI使用声明：

我使用AI的情况：
- 是否使用AI生成文字：[是（哪些部分）/否]
- 是否使用AI修改语言/润色：[是/否]
- 是否使用AI辅助代码：[是/否]
- 是否使用AI辅助分析数据：[是/否]
- 使用的工具：[Codex/ChatGPT/Grammarly/其他]

目标期刊[期刊名]的AI声明政策：
- Nature系列：要求在Methods中声明
- Elsevier：需在Author Statement中填写
- IEEE：目前建议但不强制

输出：符合[目标期刊]政策要求的AI使用声明（若无需声明也说明原因）

Common Mistakes

• 忘记识别论文类型：不同类型（discovery/methods/review）叙事结构不同，先识别类型再写作
• 写完再选刊：应该先选好目标期刊再写作，否则风格、深度、格式均可能需要大改
• 引用未核查就投稿：AI幻觉引用是退稿常见原因之一，务必使用citation-integrity.md核查
• 审稿回复编造修改：不要声称做了实验或修改却没有对应的论文位置，用[作者需提供：XXX]占位
• 忽略CRediT声明：Nature/Elsevier/Springer期刊均要求CRediT，缺少会退回要求补充
• 提示词太短：审稿类需明确"不补实验的基础上"、"生成word在桌面上"等约束
• 忘记指定输出格式：每次说清楚生成word/latex/pdf，以及生成到哪个路径
• LaTeX修订不精确：要加"精确告诉我修改哪一行，修改前后对比"，否则找不到修改位置
• 绘图前未定图表合同：先回答"这图证明什么"再绘图，否则容易做出与文章脱节的图
• 翻译后未校对：中译英后必须做"修改前标蓝，修改后标红"的对比校对
• 不做质量门控直接投稿：使用quality-gates.md确保≥28/35再提交，低分强投成功率极低