Refine

/refine

通用多轮迭代改进循环，适用于任何研究制品（idea、proposal、experiment plan、paper draft）。 每轮调用 /review 获取结构化反馈 → 解析 actionable items → Claude 修复制品 → 更新 wiki 实体 → 重新 /review，直到评分达到目标分数或达到最大轮次。 输出改进历史和最终 review 评分。

Inputs

• artifact：要改进的制品，以下之一：
  • wiki 页面的 slug（从 ideas/experiments/methods/outputs/ 中查找）
  • 文件路径（如 wiki/outputs/paper-draft-v1.md）
• --max-rounds N（可选，默认 4）：最大迭代轮次
• --target-score N（可选，默认 8）：目标 review 评分（1-10），达到后停止
• --difficulty（可选，默认 hard）：传递给 /review 的难度级别
• --focus（可选）：传递给 /review 的审查焦点

Outputs

• 改进后的 artifact（wiki 页面或文件，原地更新）
• wiki 实体更新（若 review 发现 idea/method 需加强或 gap 被识别）
• REFINE_REPORT（输出到终端）：
  • 每轮的评分变化轨迹
  • 累计修复的 issues 列表
  • 最终 review 评分和 verdict
  • 未解决的 issues（若有）

Wiki Interaction

Reads

• wiki/ideas/*.md — 若 artifact 是 idea
• wiki/experiments/*.md — 若 artifact 是 experiment plan
• wiki/methods/*.md — review 引用的 methods
• wiki/papers/*.md — review 引用的 papers
• wiki/outputs/*.md — 若 artifact 是 paper draft 或 output
• wiki/graph/context_brief.md — 传递给 /review 的全局上下文
• wiki/graph/open_questions.md — 检查是否有新 gap 需要记录

Writes

• wiki/ideas/{slug}.md — 若 artifact 是 idea，修复 review 发现的问题
• wiki/experiments/{slug}.md — 若 artifact 是 experiment plan
• wiki/methods/{slug}.md — 若 review 指出 method 缺口（如 source_papers 缺失、Procedure 偏弱）
• wiki/outputs/*.md — 若 artifact 是 paper draft 或 output
• wiki/graph/edges.jsonl — 若修复过程中发现新关系
• wiki/graph/context_brief.md — 每轮结束后重建（若 wiki 有变更）
• wiki/graph/open_questions.md — 每轮结束后重建（若 wiki 有变更）
• wiki/log.md — 追加操作日志

Graph edges created

• 视修复内容而定，可能添加：supports、addresses_gap、inspired_by 等

Workflow

前置：确认工作目录为 wiki 项目根（包含 wiki/、raw/、tools/ 的目录）。

Step 1: 初始化

1. 定位 artifact：
   • 若为 slug：按顺序在 wiki/ideas/、wiki/experiments/、wiki/methods/、wiki/outputs/、wiki/papers/ 中查找 {slug}.md
   • 若为文件路径：直接读取
   • 记录 artifact 类型和路径
2. 读取当前内容：加载 artifact 完整文本
3. 初始化追踪变量：
   • round = 0
   • score_history = []
   • fixed_issues = []
   • unresolved_issues = []
   • wiki_changes = []

Step 2: 迭代循环

重复以下步骤，直到满足终止条件：

Round N（N = 1, 2, ..., max-rounds）：

2a. 调用 /review

Skill: review
Args: "<artifact-path-or-content>" --difficulty {difficulty} --focus {focus}

解析 review 输出，提取：

• score（1-10）
• verdict（ready / needs-work / major-revision / rethink）
• weaknesses（按 severity: critical / major / minor）
• actionable_items（排序列表）
• wiki_entity_mapping（ideas/methods needing strengthening, gaps identified）

2b. 检查终止条件

• 达到目标分数：score >= target-score → 终止，输出最终报告
• 连续两轮评分无提升：score_history[-1] == score_history[-2] → 终止（已收敛）
• 达到最大轮次：round >= max-rounds → 终止
• verdict == ready：→ 终止
• verdict == rethink 且 round == 1：→ 终止并建议重新设计（不在 rethink 级别的制品上反复迭代）

2c. 分类 actionable items 并修复

对每个 actionable item 进行分类和处理：

Category A — 方法/内容问题（Claude 直接修复）：

• 方法描述不够具体 → 补充细节
• 缺少对比分析 → 添加与 baseline 的对比
• 论证逻辑不完整 → 补充推理步骤
• 表达不清晰 → 重写相关段落
• → 直接编辑 artifact 文件

Category B — wiki 知识缺口（建议外部操作）：

• idea 的 novelty 论证薄弱 → 建议重新运行 /novelty
• method 缺少 source_papers → 标记给 /ingest 复查
• 缺少相关工作引用 → 建议运行 /ingest 补充论文
• 需要实验验证 → 建议运行 /exp-run
• → 记录到 unresolved_issues，在报告中列出建议操作

Category C — idea / method 更新（Claude 修复 wiki）：

• review 指出 idea 的 origin_gaps 缺少某个 concept 链接 → 补上链接并写入反向 linked_ideas
• review 发现 method 缺少 parent/child 关系 → 修补 method 页面
• review 发现新的 gap → 记录到 gap_map（通过 rebuild）
• review 发现新的关系 → 添加 graph edge
• → 更新相关 wiki 页面，记录到 wiki_changes

Category D — 超出范围（跳过）：

• 需要新实验数据 → 无法在 refine 中解决
• 需要领域专家判断 → 标记为 unresolved
• → 记录到 unresolved_issues

2d. 更新追踪

• score_history.append(score)
• fixed_issues.extend(category_A_items + category_C_items)
• unresolved_issues.extend(category_B_items + category_D_items)
• wiki_changes.extend(category_C_changes)
• round += 1

2e. 重建派生数据（若 wiki 有变更）

若本轮有 wiki 变更（Category C）：

python3 tools/research_wiki.py rebuild-context-brief wiki/
python3 tools/research_wiki.py rebuild-open-questions wiki/

Step 3: 最终报告

迭代结束后，生成 REFINE_REPORT：

# Refine Loop Report: {artifact title}

## Summary
- **Artifact**: {slug or path}
- **Rounds**: {N} / {max-rounds}
- **Score trajectory**: {score_history, e.g., 5 → 6 → 7 → 8}
- **Final score**: {final_score}/10
- **Final verdict**: {verdict}
- **Termination reason**: {target reached / converged / max rounds / rethink}

## Issues Fixed ({count})

| Round | Issue | Severity | Fix applied |
|-------|-------|----------|-------------|
| 1 | 方法描述不够具体 | major | 补充了具体算法步骤 |
| 1 | idea novelty 论证薄弱 | major | 已标记 [[idea-slug]] 重跑 `/novelty` |
| 2 | 缺少 ablation 设计 | minor | 添加了 ablation 计划 |

## Wiki Changes Made

| Page | Change | Round |
|------|--------|-------|
| `wiki/methods/{slug}.md` | 补全缺失的 source_papers 链接 | 1 |
| `wiki/graph/edges.jsonl` | +1 edge (addresses_gap) | 2 |

## Unresolved Issues ({count})

| Issue | Severity | Suggested action |
|-------|----------|------------------|
| 缺少实验验证 | critical | Run `/exp-design {slug}` |
| 缺少对比论文 | major | Run `/ingest` for {paper-title} |

## Next Steps
- {based on verdict and unresolved issues}

追加日志：

python3 tools/research_wiki.py log wiki/ \
  "refine | {artifact-slug} | {N} rounds | score {initial}→{final} | verdict: {verdict}"

Constraints

• 每轮必须有实质进展：若连续两轮 score 无变化，必须终止（防止无限循环）
• rethink 不反复迭代：若首轮 verdict == rethink，直接终止并建议重新设计
• wiki 修改限于 review 建议：refine 只修改 review 明确建议修改的 wiki 实体，不主动扩大修改范围
• unresolved issues 必须列出：不能静默跳过无法在 loop 中解决的问题
• 保留改进历史：score_history 和 fixed_issues 完整记录，不丢弃中间状态
• review 参数透传：--difficulty 和 --focus 透传给 /review，保持审查标准一致
• artifact 原地更新：修复直接修改原始文件，不创建副本

Error Handling

• artifact 找不到：提示用户检查 slug 或路径，列出可能的候选页面
• /review 调用失败：重试一次，若仍失败则终止 loop，输出已完成的改进历史
• wiki 写入失败：记录错误，继续下一轮（wiki 变更降级为 unresolved）
• 首轮 score 已 >= target-score：直接终止，输出报告（无需改进）
• 所有 issues 都是 Category B/D：无法在 loop 中修复，终止并输出 unresolved issues 列表

Dependencies

Tools（via Bash）

• python3 tools/research_wiki.py rebuild-context-brief wiki/ — 重建 query_pack
• python3 tools/research_wiki.py rebuild-open-questions wiki/ — 重建 gap_map
• python3 tools/research_wiki.py add-edge wiki/ ... — 添加 graph edge（若需要）
• python3 tools/research_wiki.py log wiki/ "<message>" — 追加日志

Skills（via Skill tool）

• /review — 每轮审查（核心依赖）

Claude Code Native

• Read — 读取 artifact 和 wiki 页面
• Edit — 修复 artifact 内容
• Glob — 查找 artifact 和相关 wiki 页面

Shared References

• .claude/skills/shared-references/cross-model-review.md — 通过 /review 间接依赖