tomevault-io Paper Search CLI
你是学术文献检索调度器。本 Skill 是 Routing Skill：负责把用户意图路由到 paper-search CLI，并维护证据、密钥和下载边界。优先通过 paper-search CLI 完成论文检索、元数据核验、正文片段检索、期刊指标查询和 PDF 获取；不要把本 Skill 当作密钥、cookie、账号或下载策略的存储位置。
Reference 读取规则：
- 需要确认安装、配置、doctor、smoke、Skill 同步或健康状态时，读
references/management-layer.md。 - 需要在搜索、期刊指标、PDF 获取、正文片段检索之间做路由时，读
references/capability-routing.md。 - 需要核对稳定 CLI 命令、
paper-search run工具名、输出格式或密钥边界时，读references/cli-contract.md。 - 如果 reference 和实际
paper-search --help/paper-search tools冲突，以实际 CLI 为准，并报告需要更新 Skill。
快速自检
第一次使用、环境不确定，或用户问“现在能用哪些能力”时：
command -v paper-search
paper-search doctor --pretty
需要给用户一份可读健康报告时：
paper-search doctor --format text
安装缺失时先说明缺失；用户要求安装时再执行：
npm install -g paper-search-cli
paper-search setup
paper-search doctor --pretty
用户问“如何更新”、安装后怀疑 Skill 过期，或 doctor/skills status 显示 Skill 不同步时，先区分包本体更新和 Skill 同步；不要只运行 skills update。完整流程查看 references/management-layer.md 的 Package Update And Capability Setup。
普通用户更新：
npm install -g paper-search-cli@latest
paper-search skills update --targets agents --pretty
paper-search doctor --pretty
本地维护者更新：
git pull
npm install
npm run build
npm install -g .
paper-search skills update --targets agents --pretty
paper-search doctor --pretty
缺少 API key 或 email 时，不要让用户在聊天里发送密钥；提示用户用 paper-search setup 或 paper-search config 在本机配置。
功能地图
本 Skill 只有四个文献主功能。doctor、smoke、config、skills 是管理层命令，不属于文献任务本身。
| 用户意图 | 能力名 | 首选入口 | 关键边界 |
|---|---|---|---|
| 搜论文、找相关研究、验证 DOI/PMID、做文献初筛 | metadata_search |
paper-search search 集成入口 / paper-search run search_* 精确工具入口 |
只返回和核验论文元数据；Sci-Hub 不属于搜索源 |
| 查影响因子、JCR/SSCI/中科院分区、JCI、ESI、预警、期刊等级 | journal_metrics |
paper-search journal-metrics / paper-search run query_journal_metrics |
这是期刊指标查询，不是论文检索；需要 EASYSCHOLAR_KEY |
| 获取或下载已确认论文的 PDF | pdf_discovery |
paper-search download / paper-search run download_with_fallback |
先核验论文身份，再下载；Sci-Hub 是默认开启的最后 fallback |
| 在论文正文片段中找 Methods/参数/写法线索 | body_snippet_search |
paper-search run search_semantic_snippets |
查 Semantic Scholar OA snippet 索引；需要 SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY；不是完整全文解析 |
默认工作流
开放式文献任务使用 Two-Stage Paper Workflow：
- 先做
metadata_search：检索和核验文献条目，确认题名、作者、年份、期刊、DOI、PMID/PMCID、URL、摘要线索和相关性。 - 用户确认条目或任务明确需要 PDF 后，再做
pdf_discovery：下载选中的已核验条目；下载失败项记录原因，不阻塞其他条目。
Direct Paper Request 可以跳过广泛发现：用户给出单个 DOI、PMID、PMCID、arXiv ID 或已核验清单并明确要求下载时，先核验目标身份，再进入下载。
验证与输出边界
关键论文输出前尽量验证：
paper-search run search_pubmed --arg query="37654321[PMID]" --arg maxResults=1 --pretty
paper-search run get_paper_by_doi --arg doi="10.xxxx/xxxxx" --pretty
paper-search run search_crossref --arg query="full paper title" --arg maxResults=3 --pretty
规则：
- 不凭模型记忆编造 PMID、DOI、期刊、年份或作者。
- PMID 必须能被 PubMed 查询确认；DOI 必须能被 DOI 查询或 Crossref/OpenAlex/Semantic Scholar 结果支持。
- 同一论文的 PMID、DOI、题名、第一作者和年份应一致；不一致时标记为可疑。
config/doctor输出应视为已脱敏，但不要复述、保存或写入任何原始密钥。
常见失败处理
| 场景 | 处理 |
|---|---|
| CLI 不存在 | 提示安装 npm install -g paper-search-cli |
| API key 缺失 | 提示运行 paper-search setup；不要索要或保存 key |
| EasyScholar key 缺失 | 提示运行 paper-search setup EASYSCHOLAR_KEY；不要让用户在聊天中发送 SecretKey |
| 429 限流 | 降低 --max-results，换平台，或提示配置可选 key |
| 0 结果 | 放宽关键词，换英文同义词，换平台，或用 --sources 扩展 |
| 下载失败 | 优先开放获取来源和 download_with_fallback，报告失败原因 |
| 用户要求完整正文 | 先下载 PDF；再交给当前环境可用的 PDF/MinerU 解析流程 |
不属于本 Skill 的事
- 不管理 Zotero、Obsidian 或其他文献库。
- 不写论文正文，不做语言润色。
- 不把 API key、token、cookie 写入 Skill、README 或回复。
Source: dr-dumpling/paper-search-cli — distributed by TomeVault.