Pubmed Quick Search

快速文獻搜尋

描述

用 unified_search 做第一輪文獻探索。它會自動分析查詢、選擇來源、合併去重，適合快速確認某個主題是否有研究、有哪些代表性文章，以及是否值得進一步做系統性搜尋。

觸發條件

• 「幫我找...的論文」
• 「有沒有關於...的文章」
• 「先快速搜尋一下...」
• 「search papers about...」
• 「find articles on...」

核心工具

unified_search(
    query="remimazolam ICU sedation",
    limit=10,
    ranking="balanced",
    output_format="markdown"
)

參數重點

• query: 自然語言、Boolean 查詢、或包含 ICD 代碼的查詢都可以
• limit: 每個來源最多取回幾篇
• sources: 可指定 pubmed,openalex,semantic_scholar,europe_pmc,crossref
• ranking: balanced, impact, recency, quality
• filters: 以逗號分隔的篩選條件
• options: 額外旗標，例如預印本、是否深搜等

快速搜尋時，優先使用自然語言 + filters。只有在需要精細組裝查詢時，才切到系統性搜尋 skill。

最常用範例

1. 一般主題搜尋

unified_search(query="remimazolam ICU sedation", limit=10)

2. 最近幾年的臨床研究

unified_search(
    query="diabetes treatment",
    limit=20,
    ranking="quality",
    filters="year:2020-2025,species:humans,clinical_query:therapy"
)

3. 看最新研究

unified_search(
    query="lung cancer liquid biopsy",
    limit=15,
    ranking="recency"
)

4. 看高影響力文獻

unified_search(
    query="CAR-T therapy lymphoma",
    limit=15,
    ranking="impact"
)

5. 限定來源

unified_search(
    query="CRISPR gene therapy",
    sources="pubmed,openalex,europe_pmc",
    limit=20
)

6. 納入預印本

unified_search(
    query="COVID-19 vaccine efficacy",
    limit=20,
    options="preprints"
)

filters 速查

filters="year:2020-2025,age_group:aged,sex:female,species:humans,language:english,clinical_query:therapy"

可用欄位

• year: 2020-2025, 2020-, -2025, 2024
• age_group: newborn, infant, preschool, child, adolescent, young_adult, adult, middle_aged, aged, aged_80
• sex: male, female
• species: humans, animals
• language: english, chinese 等
• clinical_query: therapy, therapy_narrow, diagnosis, diagnosis_narrow, prognosis, etiology 等

options 速查

options="preprints,shallow"

常用旗標

• preprints: 納入 arXiv、medRxiv、bioRxiv
• include_detected_preprints: 保留 heuristic 偵測到的 preprints；檢測結果不能證明 peer-review 狀態
• no_oa: 不做 OA 連結補強
• no_analysis: 不顯示查詢分析
• no_scores: 不顯示分數
• no_relax: 關閉零結果時的自動放寬
• shallow: 關閉深搜，速度較快

查詢不確定時

先分析，不要直接盲搜：

analyze_search_query(query="remimazolam vs propofol for ICU sedation")

如果需要 MeSH、同義詞、建議查詢，再用：

generate_search_queries(topic="remimazolam ICU sedation")

搜尋後常見下一步

1. 讀細節：fetch_article_details(pmids="12345678")
2. 找相似研究：find_related_articles(pmid="12345678")
3. 看誰引用它：find_citing_articles(pmid="12345678")
4. 抓全文：get_fulltext(source={"kind":"pmid","value":"12345678"})
5. 匯出引用：prepare_export(pmids="last", format="ris")

若 structured output 同時有文章與 source_errors，這是 partial success，不是整次失敗：

1. 先保留已回傳的文章。
2. 用 artifact_summary.artifact_uri 讀取 audit.json 與 query_strategy.json。
3. 只有在 coverage 仍不足時，才針對 failed/retryable sources 補查。
4. 需要重現或中斷續接時，透過 read_session(request={"action":"search_runs"}) 找 run，再用 read_session(request={"action":"replay_search","run_id":"..."}) 讀取 arguments；不要從 agent hook state 重建原始 query。

什麼時候不要停在這個 skill

• 需要 MeSH 與同義詞完整展開：改用 pubmed-systematic-search
• 是臨床比較問題：改用 pubmed-pico-search
• 需要全文、圖表、PDF：改用 pubmed-fulltext-access