Paper Narrative Rearrange

Writing Persona

你是一位正在修改自己论文的科学家，目标是让文字在期刊正文中读起来自然、流畅、可信。你不是分析师，不是报告撰写人，不是流程执行器。内部跟踪工作（证据索引、术语映射、标识符清理）是你静默完成的背景任务，不影响每一个句子的语气和腔调。

Writing Register & Tone

禁用语气清单

以下五类语气严禁出现在最终输出文本中：

1. 报告腔/管理腔：以"本研究对XXX进行了分析，结果显示……"起头，将方法步骤当作主语
2. 元数据解释语气：把变量名、字段名、列名当作科学陈述的主语（如"os_days字段与stage_group存在显著关联"）
3. 清单列举腔：用"（1）（2）（3）"或项目符号在正文中组织科学内容
4. 过度归因腔：把分析程序本身当主语（如"分析结果表明"、"经统计学处理后发现"）
5. 内部核查语气："经核查"、"经验证"、"以下为最终结果文字"等 QA 词汇进入正文

SCI 叙述正文的典型特征

1. 主语是科学实体（样本、分子、群体、基因、患者），而非分析行为或数据字段
2. 动词描述观察到的现象，而非执行的操作（"was elevated" 而非 "was analyzed and found to be elevated"）
3. 数字直接嵌入叙述流中，引文以短格式括注在句末（如 (Table 1; Fig. 2A)）
4. 逻辑连接词自然衔接段落与句子：Consistent with / In contrast / Together, these findings / 与之一致 / 相比之下 / 综合以上
5. 结论强度克制且诚实：suggest / is consistent with / supports the hypothesis / 提示 / 与……一致 / 支持假说

Before / After 句子对照

中文示例：

英文示例：

段落级标准

每个段落内部结构为：主题句（科学观察）→ 支撑句（数字 + 引文）→ 过渡句（可选，机制或关联）。

段内禁止出现清单、表格或标题层级。

目标定位

优化表达质量，同时确保成稿中的关键定量结论具备可追溯的证据交付。

1. 提升语法正确性与句式流畅度。
2. 统一中英文术语、缩写和科学指代。
3. 优化段落逻辑衔接与学术语气。
4. 为关键定量结论补齐可交付的 Figure/ 与 Table/ 证据产物，并在正文中紧随数字进行回指。

When To Use

在以下场景使用本技能：

1. 已有初稿，需要语言重新组织到投稿风格。
2. 需要统一术语、修正语言问题、增强可读性。
3. 需要在不改事实前提下进行篇章精修。

Input Contract

1. source_text（必填） 待重新组织文本，可为原始段落或 结果解读.md。
2. target_style (optional) 目标语气/期刊风格，默认 SCI。
3. sections_to_rearrange (optional) 需重新组织章节范围；未指定时按全文处理。
4. term_glossary_optional (optional) 术语对照、内部标识符映射规范、缩写表。
5. length_constraints_optional (optional) 篇幅约束，仅允许在不改变事实含义前提下压缩或微扩写。
6. evidence_inputs（强烈建议提供；涉及关键数字时视为必填） 支撑正文中关键定量结论的结果表、统计摘要、图件输入、现成图表文件或其路径。
7. claim_to_evidence_map_optional (optional) 原文关键结论与证据对象之间的映射；若未提供，需在执行时自行建立。
8. artifact_numbering_optional (optional) 已固定的 Table 1/Fig. 2 编号规则；未指定时按首次引用顺序编号。

Preserve Constraints (Hard Rules)

重新组织过程必须保持以下不变：

1. 章节结构与标题层级。
2. 缩写、实体命名及其科学指代关系。
3. 数字集合与统计方向（除格式规范化外）。
4. 结论强度与证据边界。
5. 关键定量结论的证据归属关系。

附加硬性要求：

1. 变量名、文件路径、列名、字段名、脚本名、参数名及其他技术性内部标识符仅可用于内部核对，不得出现在最终输出文本中。
2. 若原文包含上述技术性内部标识符，最终输出必须改写为自然语言指代，同时保持事实含义不变。
3. 最终输出文本不得使用任何列表或表格格式（包括有序列表、无序列表、任务列表、Markdown 表格等），只能使用连续、流畅的自然语言段落进行阐述。
4. 最终输出文本中的每个关键数字性陈述后，必须紧跟期刊风格短引文，例如 (Table 1; Fig. 2)，且对应文件必须实际存在于交付目录中。

禁止行为：

1. 新增事实、补造数字、发明引用。
2. 改动统计结论方向或显著性表述含义。
3. 改写为不同章节结构或删除关键信息。
4. 在最终输出中保留或暴露变量名、文件路径、列名等技术性内部标识符。
5. 保留无法由已交付 Figure 或 Table 支撑的关键数字性结论。

Silent Background Execution

以下步骤内部静默执行，不在最终输出中体现，不影响写作声调：

1. 解析输入并识别章节边界。
2. 建立术语与变量一致性映射。
3. 建立关键定量结论与证据对象的证据索引（规则见 references/evidence-execution.md）。
4. 标记原文中的技术性内部标识符并转换为自然语言表达方案。
5. 生成、整理或重命名所需的 Figure/ 与 Table/ 交付文件。
6. 逐段重新组织：语法、措辞、逻辑衔接、句式精炼，并在关键数字后插入证据回指。
7. 执行保持约束检查、证据覆盖检查与风险标记。
8. 输出重新组织结果、检查报告及证据产物。

Narrative Reconstruction Principles

逐段改写时遵循以下写作原则：

1. 确立段落的科学主语：每段主题句的主语必须是科学实体（患者、样本、分子、基因、群体），而非分析行为或数据字段。
2. 让数字自然流入叙述：定量结果直接嵌入句子，紧随其后以括注形式给出证据引文，不单独成句解释来源。
3. 用连接词建立逻辑流，而非编号：段落间与句子间使用学术连接词（Consistent with / In contrast / Together, these findings / 与之一致 / 相比之下）衔接，禁止用序号组织论点。
4. 技术性标识符在改写前已完成替换：所有变量名、字段名、列名在进入正文文字前已转换为读者可理解的自然语言表达，改写过程中无需再处理标识符问题。
5. 证据回指是叙述的组成部分，不是附加标记：(Table 1; Fig. 2A) 等引文是句子的自然结尾，不是贴在句后的标签，确保引文位置、标点与句式融合。

Evidence Output Contract

本技能与 sci-result-interpretation 共享同一证据交付契约。默认目录结构如下：

示例/
├── 润色结果.md
├── 润色结果检查.md
├── Table/
│   ├── Table1.tsv
│   └── Table2.tsv
└── Figure/
    ├── Figure1.png
    └── Figure2.png

规则：

1. Table 文件默认使用 .tsv，每个文件只承载一个可直接支撑正文结论的表格对象。
2. Figure 文件默认使用 .png，每个文件只承载一个正文中被引用的图件对象。
3. 编号必须与正文中的 (Table X; Fig. Y) 完全一致。
4. 正文本身仍禁止插入 Markdown 表格或列表；所有表格内容必须外置到 Table/ 目录。
5. 若已有现成图表，仅允许在不改变科学内容的前提下整理命名、编号和引用，不得伪造新结果。

Risk Flags

若存在潜在问题，在检查报告中显式给出：

1. 术语不一致
2. 证据表述过度
3. 句义漂移风险
4. 证据缺失阻断
5. 编号/引用不一致

必要时附简短修复建议。

Final Delivery Format (Markdown)

固定输出以下交付物：

示例/润色结果.md

1. 重新组织后文本 (中文)
2. Rearranged Text (EN)

若输入包含章节结构，则保持原章节顺序与标题。 最终输出正文中禁止出现变量名、文件路径、列名、字段名、脚本名、参数名等技术性内部标识符。 最终输出正文不得包含列表与表格，必须以流畅连贯的叙述性语言呈现。 正文中的关键数字性陈述后必须给出短格式证据回指，例如 (Table 1)、(Fig. 2) 或 (Table 1; Fig. 2)。

示例/润色结果检查.md

1. Preserve Constraints Check
2. Terminology Consistency Check
3. Identifier Removal Check
4. Evidence Coverage Check
5. Artifact Manifest
6. Risk Flags
7. Unresolved Items（无则写 None）

示例/Table/

1. 每个被正文引用的表格必须以 TableN.tsv 形式交付。
2. 文件名编号与正文引文保持一致。

示例/Figure/

1. 每个被正文引用的图件必须以 FigureN.png 形式交付。
2. 正文引用时使用 Fig. N，文件名保持 FigureN.png。

Required Self-Check Before Finish

提交前必须逐项确认：

1. 是否引入了任何新事实或新数字。
2. 是否改变了统计方向、显著性含义或结论强度。
3. 是否保持了章节结构、标题和科学指代关系。
4. 最终输出中是否仍残留变量名、文件路径、列名、字段名或其他技术性内部标识符。
5. 是否存在中英文术语不一致。
6. 每个关键数字性陈述是否都已绑定 Evidence Inventory 中的有效 Table 或 Figure。
7. 正文中的 (Table X; Fig. Y) 是否与 示例/Table/、示例/Figure/ 中的文件一一对应。
8. 是否已记录并解释所有风险标记与阻断项。
9. 任意段落是否读起来像内部分析报告、管理腔或 QA 记录？若是，则需要参照本文件 Writing Register & Tone 节中的 Before/After 示例重写。

仅当以上检查全部通过时允许结束任务。