wesley-yin77 NSFC Hypothesis — 科学假说构建器
从已掌握的证据链中提炼科学假说，形成NSFC标书的核心灵魂。
Routing protocol
1. Load the manifest and core layer
Read manifest.yaml. Always load:
../../../_shared/core/winning-patterns.md— 科学假说的标准写法../../../_shared/core/terminology.md— 术语一致性static/core/stance.md— 默认立场
2. Detect axes
| Axis | Values | Method |
|---|---|---|
stage |
探索（用户有散落证据）/ 凝练（已有框架需精炼）/ 挑战（对现有假说进行压力测试） | 从需求检测 |
complexity |
单通路 / 双通路 / 多层级 | 从假说内容检测 |
3. Apply hypothesis construction protocol
Step 1: 证据盘点
收集用户掌握的所有证据碎片：
- 已知的基因/蛋白表达变化
- 已证实的蛋白互作/功能关系
- 已发表的文献支撑
- 预实验结果
- 生物信息学分析结果
Step 2: 逻辑链构建
将碎片化证据连接成一条逻辑链：
[分子A] → [调控方式B] → [效应分子C] → [表型D] → [疾病E]
检查链中每个环节是否都有证据支撑（预实验/文献）， 标记薄弱环节（需要用虚线标注，作为"待验证"）。
Step 3: 假说表述
按中标标书标准格式输出：
"综上所述，[证据链回顾]。由此，我们提出如下科学假说： [分子A]可能通过[调控B]影响[效应C]，从而在[疾病D]中发挥[功能E]。 为验证上述假说，我们将[简要策略]。本研究将为[意义]。"
⚠️ 假说的三层验证标准：
- 可验证性 — 能否通过实验手段检验？
- 新颖性 — 是否提出了领域内未被充分认识的关联？
- 重要性 — 如果被证实，对领域的贡献是什么？
Step 4: 关键科学问题凝练
从假说中提取2-3个"卡脖子"问题。
⚠️ 强制格式要求：中标标书中的关键科学问题均为简洁的独立问句（1-2句话），不是段落。对照22份中标标书，关键科学问题都不超过3行。
字数限制：每个关键科学问题控制在50-80字，最多不超过100字。
每个问题以问句形式呈现，问题之间应有递进关系（what → how → significance），问题应对应研究内容的逻辑层次。
典型示例：
- [分子A]是否通过[通路B]影响[疾病C]的[表型D]？（what层面）
- [分子A]调控[通路B]的具体分子机制是什么？（how层面）
- 靶向[分子A/通路B]能否成为[疾病C]的新治疗策略？（significance层面）
常见错误：
| 错误 | 中标标书的正确做法 |
|---|---|
| 关键科学问题写成100-200字的大段文字 | 每个问题1-2句，简洁到可以一眼读完 |
| 一个"关键问题"里嵌套多个子问题 | 拆分为2个独立问题 |
| 关键问题与假说重复 | 关键问题是"卡脖子之处"，假说是"可能的答案" |
Step 5: 假说可视化
建议生成"机制假说图"（可后续交由 nsfc-figure 子技能实现）：
- 已知通路用实线
- 假设关系用虚线
- "?"标注待验证环节
- 关键分子突出显示
4. Anti-patterns（假说构建中的常见误区）
基于22份中标标书与未中标标书的对比：
| 误区 | 问题 | 修正 |
|---|---|---|
| "A→B→C→D"线性链 | 过于简单，缺乏机制深度 | 增加调控方式、修饰类型、反馈环路 |
| 假说=研究意义复述 | 没有可检验的预测 | 明确"如果假说成立，我们预期观察到什么" |
| 关键科学问题=研究步骤 | 把"要做什么"当"要回答什么" | 改为认知层面的卡点 |
| 假说不可证伪 | 无论结果如何都能自圆其说 | 增加排他性预测 |
| 证据链过长 | 6+环节，逻辑松散 | 缩减至3-4个核心环节，其余放入研究基础 |
6. 假设迭代参考
在构建假说时，强烈建议加载 ../../../_shared/references/hypothesis-iteration-patterns.md，其中收录了四种经典假设迭代模式，包括：
- 模式一：相关性→必要性→充分性→特异性（LAG3泛素化/Cell 42.5分）
- 模式二：体内外矛盾→剩余法推理→新假说（TCAIM/OGDH/Molecular Cell 16.6分）
- 模式三：多组学交叉→假设迭代→机制聚焦（GCGR/GLP1R→乳酸→H3K9乳酰化 14.6分）
- 模式四：筛选→功能验证→机制扩展→多维度闭环（HMGB2/Sci Adv 12.5分）
每种模式都附有国自然适配要点和详细的分步示例。