Results for “protein-design”

3 skills

Conjunto abrangente de ferramentas para modelos de linguagem de proteínas, incluindo ESM3 (design multimodal generativo de proteínas em sequência, estrutura e função) e ESM C (embeddings e representações eficientes de proteínas). Use essa skill ao trabalhar com sequências de proteínas, estruturas ou predição de função; designing de proteínas inovadoras; geração de embeddings de proteínas; inverse folding; ou tarefas de engenharia de proteínas. Suporta tanto uso local de modelos quanto Forge API baseada em nuvem para inferência escalável.

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Alterlab Interpro

Query the EMBL-EBI InterPro REST API for protein family, domain, and functional-site annotations integrated from member databases (Pfam, PANTHER, PRINTS, SMART, SUPERFAMILY, CDD, ProSite, NCBIfam, and others). Use when predicting protein function, analyzing or comparing domain architecture, classifying a protein by family or homologous superfamily, resolving a Pfam/InterPro accession, or mapping a protein's signatures to GO terms. Not for raw UniProt entry/FASTA retrieval or AlphaFold 3D structures. Part of the AlterLab Academic Skills suite.

Plataforma de laboratório em nuvem para testes e validação automatizados de proteínas. Use ao projetar proteínas e precisar de validação experimental incluindo ensaios de ligação, testes de expressão, medições de estabilidade térmica, ensaios de atividade enzimática ou otimização de sequências de proteínas. Use também para submeter experimentos via API, rastrear status de experimentos, baixar resultados, otimizar sequências de proteínas para melhor expressão usando ferramentas computacionais (NetSolP, SoluProt, SolubleMPNN, ESM), ou gerenciar workflows de design de proteínas com validação em laboratório úmido.